Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUT8

Ccdc154, Coiled-coil domain-containing protein 154, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc154Q6RUT8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc154Q6RUT8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc154Q6RUT8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc154Q6RUT8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc154Q6RUT8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc154Q6RUT8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc154Q6RUT8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc154Q6RUT8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc154Q6RUT8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc154Q6RUT8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc154Q6RUT8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc154Q6RUT8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc154Q6RUT8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc154Q6RUT8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc154Q6RUT8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc154Q6RUT8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc154Q6RUT8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc154Q6RUT8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc154Q6RUT8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc154Q6RUT8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc154Q6RUT8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc154Q6RUT8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc154Q6RUT8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc154Q6RUT8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc154Q6RUT8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc154Q6RUT8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc154Q6RUT8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc154Q6RUT8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc154Q6RUT8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc154Q6RUT8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc154Q6RUT8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc154Q6RUT8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc154Q6RUT8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc154Q6RUT8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc154Q6RUT8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc154Q6RUT8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc154Q6RUT8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc154Q6RUT8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc154Q6RUT8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc154Q6RUT8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc154Q6RUT8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc154Q6RUT8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc154Q6RUT8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc154Q6RUT8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc154Q6RUT8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc154Q6RUT8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc154Q6RUT8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc154Q6RUT8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc154Q6RUT8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc154Q6RUT8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc154Q6RUT8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc154Q6RUT8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc154Q6RUT8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc154Q6RUT8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc154Q6RUT8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc154Q6RUT8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc154Q6RUT8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc154Q6RUT8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc154Q6RUT8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc154Q6RUT8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc154Q6RUT8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc154Q6RUT8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc154Q6RUT8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc154Q6RUT8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc154Q6RUT8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc154Q6RUT8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc154Q6RUT8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc154Q6RUT8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc154Q6RUT8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc154Q6RUT8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc154Q6RUT8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc154Q6RUT8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc154Q6RUT8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc154Q6RUT8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc154Q6RUT8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc154Q6RUT8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc154Q6RUT8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc154Q6RUT8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc154Q6RUT8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc154Q6RUT8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc154Q6RUT8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc154Q6RUT8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc154Q6RUT8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc154Q6RUT8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc154Q6RUT8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc154Q6RUT8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc154Q6RUT8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc154Q6RUT8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc154Q6RUT8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc154Q6RUT8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc154Q6RUT8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc154Q6RUT8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc154Q6RUT8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc154Q6RUT8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc154Q6RUT8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc154Q6RUT8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc154Q6RUT8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc154Q6RUT8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc154Q6RUT8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc154Q6RUT8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms