Protein–RNA interactions for Protein: Q6QD59

Bnip1, Vesicle transport protein SEC20, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnip1Q6QD59 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Bnip1Q6QD59 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Bnip1Q6QD59 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Bnip1Q6QD59 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Bnip1Q6QD59 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Bnip1Q6QD59 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Bnip1Q6QD59 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Bnip1Q6QD59 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Bnip1Q6QD59 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Bnip1Q6QD59 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Bnip1Q6QD59 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Bnip1Q6QD59 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Bnip1Q6QD59 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bnip1Q6QD59 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bnip1Q6QD59 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bnip1Q6QD59 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bnip1Q6QD59 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bnip1Q6QD59 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Bnip1Q6QD59 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Bnip1Q6QD59 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Bnip1Q6QD59 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Bnip1Q6QD59 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Bnip1Q6QD59 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Bnip1Q6QD59 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Bnip1Q6QD59 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Bnip1Q6QD59 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Bnip1Q6QD59 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Bnip1Q6QD59 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Bnip1Q6QD59 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Bnip1Q6QD59 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Bnip1Q6QD59 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Bnip1Q6QD59 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Bnip1Q6QD59 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Bnip1Q6QD59 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Bnip1Q6QD59 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Bnip1Q6QD59 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Bnip1Q6QD59 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Bnip1Q6QD59 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bnip1Q6QD59 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bnip1Q6QD59 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bnip1Q6QD59 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Bnip1Q6QD59 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Bnip1Q6QD59 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Bnip1Q6QD59 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Bnip1Q6QD59 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Bnip1Q6QD59 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Bnip1Q6QD59 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Bnip1Q6QD59 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Bnip1Q6QD59 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Bnip1Q6QD59 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Bnip1Q6QD59 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Bnip1Q6QD59 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Bnip1Q6QD59 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Bnip1Q6QD59 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Bnip1Q6QD59 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Bnip1Q6QD59 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Bnip1Q6QD59 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bnip1Q6QD59 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bnip1Q6QD59 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bnip1Q6QD59 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bnip1Q6QD59 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Bnip1Q6QD59 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Bnip1Q6QD59 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Bnip1Q6QD59 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Bnip1Q6QD59 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Bnip1Q6QD59 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Bnip1Q6QD59 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Bnip1Q6QD59 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Bnip1Q6QD59 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Bnip1Q6QD59 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Bnip1Q6QD59 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Bnip1Q6QD59 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Bnip1Q6QD59 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Bnip1Q6QD59 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Bnip1Q6QD59 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Bnip1Q6QD59 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Bnip1Q6QD59 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Bnip1Q6QD59 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Bnip1Q6QD59 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Bnip1Q6QD59 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Bnip1Q6QD59 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Bnip1Q6QD59 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Bnip1Q6QD59 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Bnip1Q6QD59 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Bnip1Q6QD59 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Bnip1Q6QD59 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Bnip1Q6QD59 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Bnip1Q6QD59 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Bnip1Q6QD59 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bnip1Q6QD59 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bnip1Q6QD59 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Bnip1Q6QD59 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bnip1Q6QD59 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bnip1Q6QD59 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Bnip1Q6QD59 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Bnip1Q6QD59 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Bnip1Q6QD59 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Bnip1Q6QD59 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Bnip1Q6QD59 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Bnip1Q6QD59 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms