Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q473

Clca4a, Calcium-activated chloride channel regulator 4A, mousemouse

Predictions only

Length 924 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca4aQ6Q473 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clca4aQ6Q473 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clca4aQ6Q473 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clca4aQ6Q473 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clca4aQ6Q473 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clca4aQ6Q473 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clca4aQ6Q473 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clca4aQ6Q473 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clca4aQ6Q473 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Clca4aQ6Q473 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clca4aQ6Q473 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clca4aQ6Q473 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clca4aQ6Q473 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clca4aQ6Q473 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clca4aQ6Q473 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clca4aQ6Q473 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clca4aQ6Q473 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Clca4aQ6Q473 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Clca4aQ6Q473 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Clca4aQ6Q473 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Clca4aQ6Q473 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Clca4aQ6Q473 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Clca4aQ6Q473 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Clca4aQ6Q473 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Clca4aQ6Q473 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Clca4aQ6Q473 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Clca4aQ6Q473 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Clca4aQ6Q473 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Clca4aQ6Q473 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Clca4aQ6Q473 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Clca4aQ6Q473 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Clca4aQ6Q473 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Clca4aQ6Q473 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Clca4aQ6Q473 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Clca4aQ6Q473 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Clca4aQ6Q473 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Clca4aQ6Q473 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Clca4aQ6Q473 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Clca4aQ6Q473 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Clca4aQ6Q473 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Clca4aQ6Q473 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Clca4aQ6Q473 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Clca4aQ6Q473 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clca4aQ6Q473 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clca4aQ6Q473 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clca4aQ6Q473 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clca4aQ6Q473 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clca4aQ6Q473 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clca4aQ6Q473 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clca4aQ6Q473 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Clca4aQ6Q473 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Clca4aQ6Q473 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Clca4aQ6Q473 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Clca4aQ6Q473 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Clca4aQ6Q473 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Clca4aQ6Q473 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clca4aQ6Q473 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clca4aQ6Q473 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clca4aQ6Q473 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clca4aQ6Q473 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clca4aQ6Q473 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clca4aQ6Q473 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clca4aQ6Q473 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clca4aQ6Q473 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clca4aQ6Q473 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clca4aQ6Q473 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clca4aQ6Q473 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clca4aQ6Q473 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clca4aQ6Q473 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clca4aQ6Q473 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clca4aQ6Q473 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clca4aQ6Q473 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clca4aQ6Q473 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clca4aQ6Q473 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clca4aQ6Q473 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clca4aQ6Q473 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Clca4aQ6Q473 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clca4aQ6Q473 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clca4aQ6Q473 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Clca4aQ6Q473 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clca4aQ6Q473 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clca4aQ6Q473 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clca4aQ6Q473 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clca4aQ6Q473 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Clca4aQ6Q473 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clca4aQ6Q473 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clca4aQ6Q473 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clca4aQ6Q473 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clca4aQ6Q473 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clca4aQ6Q473 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clca4aQ6Q473 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clca4aQ6Q473 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clca4aQ6Q473 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Clca4aQ6Q473 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Clca4aQ6Q473 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Clca4aQ6Q473 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Clca4aQ6Q473 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Clca4aQ6Q473 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clca4aQ6Q473 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clca4aQ6Q473 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms