Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nudcd1Q6PIP5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nudcd1Q6PIP5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nudcd1Q6PIP5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nudcd1Q6PIP5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Nudcd1Q6PIP5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nudcd1Q6PIP5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nudcd1Q6PIP5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nudcd1Q6PIP5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nudcd1Q6PIP5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nudcd1Q6PIP5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nudcd1Q6PIP5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nudcd1Q6PIP5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nudcd1Q6PIP5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nudcd1Q6PIP5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nudcd1Q6PIP5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nudcd1Q6PIP5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nudcd1Q6PIP5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nudcd1Q6PIP5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nudcd1Q6PIP5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nudcd1Q6PIP5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nudcd1Q6PIP5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nudcd1Q6PIP5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nudcd1Q6PIP5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nudcd1Q6PIP5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Nudcd1Q6PIP5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nudcd1Q6PIP5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nudcd1Q6PIP5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nudcd1Q6PIP5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nudcd1Q6PIP5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nudcd1Q6PIP5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nudcd1Q6PIP5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nudcd1Q6PIP5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nudcd1Q6PIP5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nudcd1Q6PIP5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nudcd1Q6PIP5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nudcd1Q6PIP5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nudcd1Q6PIP5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nudcd1Q6PIP5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nudcd1Q6PIP5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nudcd1Q6PIP5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nudcd1Q6PIP5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Nudcd1Q6PIP5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nudcd1Q6PIP5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nudcd1Q6PIP5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Nudcd1Q6PIP5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nudcd1Q6PIP5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nudcd1Q6PIP5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Nudcd1Q6PIP5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nudcd1Q6PIP5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nudcd1Q6PIP5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nudcd1Q6PIP5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nudcd1Q6PIP5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nudcd1Q6PIP5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nudcd1Q6PIP5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nudcd1Q6PIP5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nudcd1Q6PIP5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Nudcd1Q6PIP5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nudcd1Q6PIP5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nudcd1Q6PIP5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nudcd1Q6PIP5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nudcd1Q6PIP5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nudcd1Q6PIP5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nudcd1Q6PIP5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nudcd1Q6PIP5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nudcd1Q6PIP5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nudcd1Q6PIP5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nudcd1Q6PIP5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Nudcd1Q6PIP5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nudcd1Q6PIP5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nudcd1Q6PIP5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nudcd1Q6PIP5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nudcd1Q6PIP5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nudcd1Q6PIP5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nudcd1Q6PIP5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nudcd1Q6PIP5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nudcd1Q6PIP5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nudcd1Q6PIP5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nudcd1Q6PIP5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nudcd1Q6PIP5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nudcd1Q6PIP5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nudcd1Q6PIP5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nudcd1Q6PIP5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nudcd1Q6PIP5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nudcd1Q6PIP5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nudcd1Q6PIP5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nudcd1Q6PIP5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nudcd1Q6PIP5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nudcd1Q6PIP5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nudcd1Q6PIP5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nudcd1Q6PIP5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nudcd1Q6PIP5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Nudcd1Q6PIP5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nudcd1Q6PIP5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Nudcd1Q6PIP5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nudcd1Q6PIP5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nudcd1Q6PIP5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nudcd1Q6PIP5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nudcd1Q6PIP5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nudcd1Q6PIP5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms