Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CtifQ6PEE2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CtifQ6PEE2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CtifQ6PEE2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CtifQ6PEE2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CtifQ6PEE2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CtifQ6PEE2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CtifQ6PEE2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CtifQ6PEE2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CtifQ6PEE2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CtifQ6PEE2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CtifQ6PEE2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CtifQ6PEE2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CtifQ6PEE2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CtifQ6PEE2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CtifQ6PEE2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CtifQ6PEE2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CtifQ6PEE2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CtifQ6PEE2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CtifQ6PEE2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CtifQ6PEE2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CtifQ6PEE2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CtifQ6PEE2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CtifQ6PEE2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CtifQ6PEE2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CtifQ6PEE2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CtifQ6PEE2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CtifQ6PEE2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CtifQ6PEE2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CtifQ6PEE2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CtifQ6PEE2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CtifQ6PEE2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CtifQ6PEE2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CtifQ6PEE2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CtifQ6PEE2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CtifQ6PEE2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CtifQ6PEE2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CtifQ6PEE2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CtifQ6PEE2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CtifQ6PEE2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CtifQ6PEE2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CtifQ6PEE2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CtifQ6PEE2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CtifQ6PEE2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CtifQ6PEE2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CtifQ6PEE2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CtifQ6PEE2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CtifQ6PEE2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CtifQ6PEE2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CtifQ6PEE2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CtifQ6PEE2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CtifQ6PEE2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CtifQ6PEE2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CtifQ6PEE2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CtifQ6PEE2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CtifQ6PEE2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CtifQ6PEE2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CtifQ6PEE2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CtifQ6PEE2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CtifQ6PEE2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CtifQ6PEE2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CtifQ6PEE2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CtifQ6PEE2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CtifQ6PEE2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CtifQ6PEE2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CtifQ6PEE2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CtifQ6PEE2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CtifQ6PEE2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CtifQ6PEE2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CtifQ6PEE2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CtifQ6PEE2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CtifQ6PEE2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CtifQ6PEE2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CtifQ6PEE2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CtifQ6PEE2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CtifQ6PEE2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CtifQ6PEE2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CtifQ6PEE2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CtifQ6PEE2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CtifQ6PEE2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CtifQ6PEE2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CtifQ6PEE2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CtifQ6PEE2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CtifQ6PEE2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CtifQ6PEE2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CtifQ6PEE2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CtifQ6PEE2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CtifQ6PEE2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CtifQ6PEE2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CtifQ6PEE2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CtifQ6PEE2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CtifQ6PEE2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CtifQ6PEE2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CtifQ6PEE2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CtifQ6PEE2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CtifQ6PEE2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CtifQ6PEE2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CtifQ6PEE2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CtifQ6PEE2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CtifQ6PEE2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
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