Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE55

Pdgfrl, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrlQ6PE55 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PdgfrlQ6PE55 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PdgfrlQ6PE55 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PdgfrlQ6PE55 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PdgfrlQ6PE55 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PdgfrlQ6PE55 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PdgfrlQ6PE55 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PdgfrlQ6PE55 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PdgfrlQ6PE55 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PdgfrlQ6PE55 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PdgfrlQ6PE55 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PdgfrlQ6PE55 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PdgfrlQ6PE55 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PdgfrlQ6PE55 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PdgfrlQ6PE55 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PdgfrlQ6PE55 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PdgfrlQ6PE55 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PdgfrlQ6PE55 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PdgfrlQ6PE55 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PdgfrlQ6PE55 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PdgfrlQ6PE55 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PdgfrlQ6PE55 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PdgfrlQ6PE55 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PdgfrlQ6PE55 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PdgfrlQ6PE55 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PdgfrlQ6PE55 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PdgfrlQ6PE55 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PdgfrlQ6PE55 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PdgfrlQ6PE55 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PdgfrlQ6PE55 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PdgfrlQ6PE55 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PdgfrlQ6PE55 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PdgfrlQ6PE55 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PdgfrlQ6PE55 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PdgfrlQ6PE55 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PdgfrlQ6PE55 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PdgfrlQ6PE55 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PdgfrlQ6PE55 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PdgfrlQ6PE55 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PdgfrlQ6PE55 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PdgfrlQ6PE55 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PdgfrlQ6PE55 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PdgfrlQ6PE55 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PdgfrlQ6PE55 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PdgfrlQ6PE55 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PdgfrlQ6PE55 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PdgfrlQ6PE55 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PdgfrlQ6PE55 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PdgfrlQ6PE55 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PdgfrlQ6PE55 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PdgfrlQ6PE55 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PdgfrlQ6PE55 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PdgfrlQ6PE55 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PdgfrlQ6PE55 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PdgfrlQ6PE55 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PdgfrlQ6PE55 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PdgfrlQ6PE55 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PdgfrlQ6PE55 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PdgfrlQ6PE55 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PdgfrlQ6PE55 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PdgfrlQ6PE55 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PdgfrlQ6PE55 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PdgfrlQ6PE55 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PdgfrlQ6PE55 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PdgfrlQ6PE55 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PdgfrlQ6PE55 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PdgfrlQ6PE55 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PdgfrlQ6PE55 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PdgfrlQ6PE55 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PdgfrlQ6PE55 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PdgfrlQ6PE55 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PdgfrlQ6PE55 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PdgfrlQ6PE55 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PdgfrlQ6PE55 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PdgfrlQ6PE55 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PdgfrlQ6PE55 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PdgfrlQ6PE55 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PdgfrlQ6PE55 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PdgfrlQ6PE55 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PdgfrlQ6PE55 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PdgfrlQ6PE55 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PdgfrlQ6PE55 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PdgfrlQ6PE55 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PdgfrlQ6PE55 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PdgfrlQ6PE55 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PdgfrlQ6PE55 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PdgfrlQ6PE55 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PdgfrlQ6PE55 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PdgfrlQ6PE55 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PdgfrlQ6PE55 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PdgfrlQ6PE55 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PdgfrlQ6PE55 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PdgfrlQ6PE55 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PdgfrlQ6PE55 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PdgfrlQ6PE55 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PdgfrlQ6PE55 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PdgfrlQ6PE55 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PdgfrlQ6PE55 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PdgfrlQ6PE55 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PdgfrlQ6PE55 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.1 ms