Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc85bQ6PDY0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc85bQ6PDY0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc85bQ6PDY0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc85bQ6PDY0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc85bQ6PDY0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc85bQ6PDY0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc85bQ6PDY0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc85bQ6PDY0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc85bQ6PDY0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc85bQ6PDY0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc85bQ6PDY0 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc85bQ6PDY0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc85bQ6PDY0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc85bQ6PDY0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc85bQ6PDY0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc85bQ6PDY0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc85bQ6PDY0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc85bQ6PDY0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc85bQ6PDY0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc85bQ6PDY0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc85bQ6PDY0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc85bQ6PDY0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc85bQ6PDY0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc85bQ6PDY0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc85bQ6PDY0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc85bQ6PDY0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc85bQ6PDY0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc85bQ6PDY0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc85bQ6PDY0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc85bQ6PDY0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc85bQ6PDY0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc85bQ6PDY0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc85bQ6PDY0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc85bQ6PDY0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc85bQ6PDY0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc85bQ6PDY0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc85bQ6PDY0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc85bQ6PDY0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc85bQ6PDY0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc85bQ6PDY0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc85bQ6PDY0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc85bQ6PDY0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc85bQ6PDY0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc85bQ6PDY0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc85bQ6PDY0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc85bQ6PDY0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc85bQ6PDY0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc85bQ6PDY0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc85bQ6PDY0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc85bQ6PDY0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc85bQ6PDY0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc85bQ6PDY0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc85bQ6PDY0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc85bQ6PDY0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc85bQ6PDY0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc85bQ6PDY0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc85bQ6PDY0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc85bQ6PDY0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc85bQ6PDY0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc85bQ6PDY0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc85bQ6PDY0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc85bQ6PDY0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc85bQ6PDY0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc85bQ6PDY0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc85bQ6PDY0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc85bQ6PDY0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc85bQ6PDY0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc85bQ6PDY0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc85bQ6PDY0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc85bQ6PDY0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc85bQ6PDY0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc85bQ6PDY0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc85bQ6PDY0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc85bQ6PDY0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc85bQ6PDY0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc85bQ6PDY0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc85bQ6PDY0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc85bQ6PDY0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc85bQ6PDY0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc85bQ6PDY0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc85bQ6PDY0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc85bQ6PDY0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc85bQ6PDY0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc85bQ6PDY0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc85bQ6PDY0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc85bQ6PDY0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc85bQ6PDY0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc85bQ6PDY0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc85bQ6PDY0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc85bQ6PDY0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc85bQ6PDY0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc85bQ6PDY0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc85bQ6PDY0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc85bQ6PDY0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms