Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDM4

Ccdc36, Interactor of HORMAD1 protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc36Q6PDM4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc36Q6PDM4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc36Q6PDM4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc36Q6PDM4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc36Q6PDM4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc36Q6PDM4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc36Q6PDM4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc36Q6PDM4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc36Q6PDM4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc36Q6PDM4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc36Q6PDM4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc36Q6PDM4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc36Q6PDM4 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc36Q6PDM4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc36Q6PDM4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc36Q6PDM4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc36Q6PDM4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc36Q6PDM4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc36Q6PDM4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc36Q6PDM4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc36Q6PDM4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc36Q6PDM4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc36Q6PDM4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc36Q6PDM4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc36Q6PDM4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc36Q6PDM4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc36Q6PDM4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc36Q6PDM4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc36Q6PDM4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc36Q6PDM4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc36Q6PDM4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc36Q6PDM4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc36Q6PDM4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc36Q6PDM4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc36Q6PDM4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc36Q6PDM4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc36Q6PDM4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc36Q6PDM4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc36Q6PDM4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc36Q6PDM4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc36Q6PDM4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc36Q6PDM4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc36Q6PDM4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc36Q6PDM4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc36Q6PDM4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc36Q6PDM4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc36Q6PDM4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc36Q6PDM4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc36Q6PDM4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc36Q6PDM4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc36Q6PDM4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc36Q6PDM4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc36Q6PDM4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc36Q6PDM4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc36Q6PDM4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc36Q6PDM4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc36Q6PDM4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc36Q6PDM4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc36Q6PDM4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc36Q6PDM4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc36Q6PDM4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc36Q6PDM4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc36Q6PDM4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc36Q6PDM4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc36Q6PDM4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc36Q6PDM4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc36Q6PDM4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc36Q6PDM4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc36Q6PDM4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc36Q6PDM4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc36Q6PDM4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc36Q6PDM4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc36Q6PDM4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc36Q6PDM4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc36Q6PDM4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc36Q6PDM4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc36Q6PDM4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc36Q6PDM4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc36Q6PDM4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc36Q6PDM4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc36Q6PDM4 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc36Q6PDM4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc36Q6PDM4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc36Q6PDM4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc36Q6PDM4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc36Q6PDM4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc36Q6PDM4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc36Q6PDM4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc36Q6PDM4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc36Q6PDM4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc36Q6PDM4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc36Q6PDM4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc36Q6PDM4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc36Q6PDM4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc36Q6PDM4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc36Q6PDM4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc36Q6PDM4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc36Q6PDM4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc36Q6PDM4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc36Q6PDM4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 184.7 ms