Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDG5

Smarcc2, SWI/SNF complex subunit SMARCC2, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc2Q6PDG5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smarcc2Q6PDG5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smarcc2Q6PDG5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smarcc2Q6PDG5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smarcc2Q6PDG5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smarcc2Q6PDG5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smarcc2Q6PDG5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smarcc2Q6PDG5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smarcc2Q6PDG5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smarcc2Q6PDG5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smarcc2Q6PDG5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smarcc2Q6PDG5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smarcc2Q6PDG5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smarcc2Q6PDG5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smarcc2Q6PDG5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smarcc2Q6PDG5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smarcc2Q6PDG5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Smarcc2Q6PDG5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Smarcc2Q6PDG5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Smarcc2Q6PDG5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Smarcc2Q6PDG5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Smarcc2Q6PDG5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smarcc2Q6PDG5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smarcc2Q6PDG5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smarcc2Q6PDG5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Smarcc2Q6PDG5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Smarcc2Q6PDG5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Smarcc2Q6PDG5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Smarcc2Q6PDG5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Smarcc2Q6PDG5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Smarcc2Q6PDG5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Smarcc2Q6PDG5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smarcc2Q6PDG5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smarcc2Q6PDG5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smarcc2Q6PDG5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smarcc2Q6PDG5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Smarcc2Q6PDG5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smarcc2Q6PDG5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smarcc2Q6PDG5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smarcc2Q6PDG5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smarcc2Q6PDG5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smarcc2Q6PDG5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smarcc2Q6PDG5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smarcc2Q6PDG5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smarcc2Q6PDG5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smarcc2Q6PDG5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smarcc2Q6PDG5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smarcc2Q6PDG5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smarcc2Q6PDG5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smarcc2Q6PDG5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smarcc2Q6PDG5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smarcc2Q6PDG5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smarcc2Q6PDG5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smarcc2Q6PDG5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smarcc2Q6PDG5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smarcc2Q6PDG5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smarcc2Q6PDG5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Smarcc2Q6PDG5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smarcc2Q6PDG5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smarcc2Q6PDG5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smarcc2Q6PDG5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smarcc2Q6PDG5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smarcc2Q6PDG5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smarcc2Q6PDG5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smarcc2Q6PDG5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smarcc2Q6PDG5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Smarcc2Q6PDG5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Smarcc2Q6PDG5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Smarcc2Q6PDG5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Smarcc2Q6PDG5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Smarcc2Q6PDG5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smarcc2Q6PDG5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smarcc2Q6PDG5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Smarcc2Q6PDG5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smarcc2Q6PDG5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smarcc2Q6PDG5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smarcc2Q6PDG5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smarcc2Q6PDG5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smarcc2Q6PDG5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smarcc2Q6PDG5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smarcc2Q6PDG5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smarcc2Q6PDG5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smarcc2Q6PDG5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smarcc2Q6PDG5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Smarcc2Q6PDG5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Smarcc2Q6PDG5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Smarcc2Q6PDG5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Smarcc2Q6PDG5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smarcc2Q6PDG5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smarcc2Q6PDG5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smarcc2Q6PDG5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Smarcc2Q6PDG5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smarcc2Q6PDG5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smarcc2Q6PDG5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smarcc2Q6PDG5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smarcc2Q6PDG5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Smarcc2Q6PDG5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smarcc2Q6PDG5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smarcc2Q6PDG5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smarcc2Q6PDG5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms