Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAJ1

Bcr, Breakpoint cluster region protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcrQ6PAJ1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
BcrQ6PAJ1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BcrQ6PAJ1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BcrQ6PAJ1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BcrQ6PAJ1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BcrQ6PAJ1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BcrQ6PAJ1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BcrQ6PAJ1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
BcrQ6PAJ1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BcrQ6PAJ1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BcrQ6PAJ1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BcrQ6PAJ1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BcrQ6PAJ1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BcrQ6PAJ1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BcrQ6PAJ1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BcrQ6PAJ1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BcrQ6PAJ1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BcrQ6PAJ1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BcrQ6PAJ1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BcrQ6PAJ1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BcrQ6PAJ1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BcrQ6PAJ1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BcrQ6PAJ1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BcrQ6PAJ1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BcrQ6PAJ1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BcrQ6PAJ1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BcrQ6PAJ1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BcrQ6PAJ1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BcrQ6PAJ1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BcrQ6PAJ1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BcrQ6PAJ1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BcrQ6PAJ1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BcrQ6PAJ1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BcrQ6PAJ1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BcrQ6PAJ1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BcrQ6PAJ1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BcrQ6PAJ1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
BcrQ6PAJ1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BcrQ6PAJ1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
BcrQ6PAJ1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BcrQ6PAJ1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
BcrQ6PAJ1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
BcrQ6PAJ1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
BcrQ6PAJ1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BcrQ6PAJ1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BcrQ6PAJ1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
BcrQ6PAJ1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BcrQ6PAJ1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
BcrQ6PAJ1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BcrQ6PAJ1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BcrQ6PAJ1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BcrQ6PAJ1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BcrQ6PAJ1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BcrQ6PAJ1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BcrQ6PAJ1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BcrQ6PAJ1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
BcrQ6PAJ1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BcrQ6PAJ1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
BcrQ6PAJ1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BcrQ6PAJ1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BcrQ6PAJ1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BcrQ6PAJ1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BcrQ6PAJ1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BcrQ6PAJ1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
BcrQ6PAJ1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BcrQ6PAJ1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BcrQ6PAJ1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BcrQ6PAJ1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BcrQ6PAJ1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BcrQ6PAJ1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BcrQ6PAJ1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BcrQ6PAJ1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BcrQ6PAJ1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BcrQ6PAJ1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BcrQ6PAJ1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BcrQ6PAJ1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BcrQ6PAJ1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BcrQ6PAJ1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BcrQ6PAJ1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BcrQ6PAJ1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
BcrQ6PAJ1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BcrQ6PAJ1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BcrQ6PAJ1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BcrQ6PAJ1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BcrQ6PAJ1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BcrQ6PAJ1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BcrQ6PAJ1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BcrQ6PAJ1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BcrQ6PAJ1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BcrQ6PAJ1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BcrQ6PAJ1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BcrQ6PAJ1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BcrQ6PAJ1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BcrQ6PAJ1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BcrQ6PAJ1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BcrQ6PAJ1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BcrQ6PAJ1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BcrQ6PAJ1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BcrQ6PAJ1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BcrQ6PAJ1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.4 ms