Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K8

Cpa4, Carboxypeptidase A4, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpa4Q6P8K8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Cpa4Q6P8K8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cpa4Q6P8K8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cpa4Q6P8K8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cpa4Q6P8K8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cpa4Q6P8K8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Cpa4Q6P8K8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cpa4Q6P8K8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cpa4Q6P8K8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cpa4Q6P8K8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cpa4Q6P8K8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cpa4Q6P8K8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cpa4Q6P8K8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cpa4Q6P8K8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cpa4Q6P8K8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cpa4Q6P8K8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cpa4Q6P8K8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cpa4Q6P8K8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cpa4Q6P8K8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cpa4Q6P8K8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cpa4Q6P8K8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cpa4Q6P8K8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cpa4Q6P8K8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cpa4Q6P8K8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cpa4Q6P8K8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cpa4Q6P8K8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cpa4Q6P8K8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cpa4Q6P8K8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cpa4Q6P8K8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cpa4Q6P8K8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cpa4Q6P8K8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cpa4Q6P8K8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cpa4Q6P8K8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cpa4Q6P8K8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Cpa4Q6P8K8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cpa4Q6P8K8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cpa4Q6P8K8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cpa4Q6P8K8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cpa4Q6P8K8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Cpa4Q6P8K8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cpa4Q6P8K8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Cpa4Q6P8K8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cpa4Q6P8K8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Cpa4Q6P8K8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cpa4Q6P8K8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cpa4Q6P8K8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cpa4Q6P8K8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cpa4Q6P8K8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cpa4Q6P8K8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cpa4Q6P8K8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cpa4Q6P8K8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cpa4Q6P8K8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cpa4Q6P8K8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cpa4Q6P8K8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cpa4Q6P8K8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cpa4Q6P8K8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Cpa4Q6P8K8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cpa4Q6P8K8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cpa4Q6P8K8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cpa4Q6P8K8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cpa4Q6P8K8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cpa4Q6P8K8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cpa4Q6P8K8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cpa4Q6P8K8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cpa4Q6P8K8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cpa4Q6P8K8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cpa4Q6P8K8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cpa4Q6P8K8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Cpa4Q6P8K8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Cpa4Q6P8K8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cpa4Q6P8K8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cpa4Q6P8K8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cpa4Q6P8K8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cpa4Q6P8K8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cpa4Q6P8K8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cpa4Q6P8K8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cpa4Q6P8K8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cpa4Q6P8K8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cpa4Q6P8K8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cpa4Q6P8K8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cpa4Q6P8K8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Cpa4Q6P8K8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cpa4Q6P8K8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cpa4Q6P8K8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cpa4Q6P8K8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cpa4Q6P8K8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cpa4Q6P8K8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cpa4Q6P8K8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cpa4Q6P8K8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cpa4Q6P8K8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cpa4Q6P8K8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Cpa4Q6P8K8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cpa4Q6P8K8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cpa4Q6P8K8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cpa4Q6P8K8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cpa4Q6P8K8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cpa4Q6P8K8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cpa4Q6P8K8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cpa4Q6P8K8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cpa4Q6P8K8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms