Protein–RNA interactions for Protein: Q6P7W5

Tsen2, tRNA-splicing endonuclease subunit Sen2, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsen2Q6P7W5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tsen2Q6P7W5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tsen2Q6P7W5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Tsen2Q6P7W5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tsen2Q6P7W5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tsen2Q6P7W5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tsen2Q6P7W5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tsen2Q6P7W5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tsen2Q6P7W5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tsen2Q6P7W5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tsen2Q6P7W5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tsen2Q6P7W5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tsen2Q6P7W5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tsen2Q6P7W5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tsen2Q6P7W5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tsen2Q6P7W5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tsen2Q6P7W5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tsen2Q6P7W5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tsen2Q6P7W5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Tsen2Q6P7W5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tsen2Q6P7W5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tsen2Q6P7W5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tsen2Q6P7W5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tsen2Q6P7W5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tsen2Q6P7W5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tsen2Q6P7W5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Tsen2Q6P7W5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tsen2Q6P7W5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tsen2Q6P7W5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tsen2Q6P7W5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tsen2Q6P7W5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Tsen2Q6P7W5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tsen2Q6P7W5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tsen2Q6P7W5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tsen2Q6P7W5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tsen2Q6P7W5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tsen2Q6P7W5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tsen2Q6P7W5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tsen2Q6P7W5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tsen2Q6P7W5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tsen2Q6P7W5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tsen2Q6P7W5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tsen2Q6P7W5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tsen2Q6P7W5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tsen2Q6P7W5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tsen2Q6P7W5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tsen2Q6P7W5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tsen2Q6P7W5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tsen2Q6P7W5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tsen2Q6P7W5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tsen2Q6P7W5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tsen2Q6P7W5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tsen2Q6P7W5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tsen2Q6P7W5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tsen2Q6P7W5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Tsen2Q6P7W5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tsen2Q6P7W5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Tsen2Q6P7W5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tsen2Q6P7W5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tsen2Q6P7W5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tsen2Q6P7W5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tsen2Q6P7W5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tsen2Q6P7W5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tsen2Q6P7W5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tsen2Q6P7W5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Tsen2Q6P7W5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Tsen2Q6P7W5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Tsen2Q6P7W5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Tsen2Q6P7W5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Tsen2Q6P7W5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Tsen2Q6P7W5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Tsen2Q6P7W5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tsen2Q6P7W5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tsen2Q6P7W5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tsen2Q6P7W5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tsen2Q6P7W5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tsen2Q6P7W5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tsen2Q6P7W5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tsen2Q6P7W5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tsen2Q6P7W5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tsen2Q6P7W5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tsen2Q6P7W5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tsen2Q6P7W5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tsen2Q6P7W5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tsen2Q6P7W5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tsen2Q6P7W5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tsen2Q6P7W5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tsen2Q6P7W5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tsen2Q6P7W5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Tsen2Q6P7W5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tsen2Q6P7W5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tsen2Q6P7W5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tsen2Q6P7W5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tsen2Q6P7W5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tsen2Q6P7W5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tsen2Q6P7W5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tsen2Q6P7W5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tsen2Q6P7W5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tsen2Q6P7W5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tsen2Q6P7W5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 205.8 ms