Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5U8

Ccdc148, Coiled-coil domain-containing protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc148Q6P5U8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc148Q6P5U8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc148Q6P5U8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc148Q6P5U8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc148Q6P5U8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc148Q6P5U8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc148Q6P5U8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc148Q6P5U8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc148Q6P5U8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc148Q6P5U8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc148Q6P5U8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc148Q6P5U8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc148Q6P5U8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc148Q6P5U8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc148Q6P5U8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc148Q6P5U8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc148Q6P5U8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc148Q6P5U8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc148Q6P5U8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc148Q6P5U8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc148Q6P5U8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc148Q6P5U8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc148Q6P5U8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc148Q6P5U8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc148Q6P5U8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc148Q6P5U8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc148Q6P5U8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc148Q6P5U8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc148Q6P5U8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc148Q6P5U8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc148Q6P5U8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc148Q6P5U8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc148Q6P5U8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc148Q6P5U8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc148Q6P5U8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc148Q6P5U8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc148Q6P5U8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc148Q6P5U8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc148Q6P5U8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc148Q6P5U8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc148Q6P5U8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc148Q6P5U8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc148Q6P5U8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc148Q6P5U8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc148Q6P5U8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc148Q6P5U8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc148Q6P5U8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc148Q6P5U8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc148Q6P5U8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc148Q6P5U8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc148Q6P5U8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc148Q6P5U8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc148Q6P5U8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc148Q6P5U8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc148Q6P5U8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc148Q6P5U8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc148Q6P5U8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc148Q6P5U8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc148Q6P5U8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc148Q6P5U8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc148Q6P5U8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc148Q6P5U8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc148Q6P5U8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc148Q6P5U8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc148Q6P5U8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc148Q6P5U8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc148Q6P5U8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc148Q6P5U8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc148Q6P5U8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc148Q6P5U8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc148Q6P5U8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc148Q6P5U8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc148Q6P5U8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc148Q6P5U8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc148Q6P5U8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc148Q6P5U8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc148Q6P5U8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc148Q6P5U8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc148Q6P5U8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc148Q6P5U8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ccdc148Q6P5U8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc148Q6P5U8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc148Q6P5U8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc148Q6P5U8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc148Q6P5U8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc148Q6P5U8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc148Q6P5U8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc148Q6P5U8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc148Q6P5U8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc148Q6P5U8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc148Q6P5U8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc148Q6P5U8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc148Q6P5U8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc148Q6P5U8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc148Q6P5U8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc148Q6P5U8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc148Q6P5U8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc148Q6P5U8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc148Q6P5U8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc148Q6P5U8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms