Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T1

Snx19, Sorting nexin-19, mousemouse

Predictions only

Length 997 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx19Q6P4T1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snx19Q6P4T1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snx19Q6P4T1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snx19Q6P4T1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snx19Q6P4T1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snx19Q6P4T1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snx19Q6P4T1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snx19Q6P4T1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snx19Q6P4T1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snx19Q6P4T1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snx19Q6P4T1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snx19Q6P4T1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snx19Q6P4T1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snx19Q6P4T1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snx19Q6P4T1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snx19Q6P4T1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snx19Q6P4T1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snx19Q6P4T1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Snx19Q6P4T1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snx19Q6P4T1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snx19Q6P4T1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Snx19Q6P4T1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Snx19Q6P4T1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snx19Q6P4T1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snx19Q6P4T1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snx19Q6P4T1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snx19Q6P4T1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snx19Q6P4T1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snx19Q6P4T1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snx19Q6P4T1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snx19Q6P4T1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Snx19Q6P4T1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snx19Q6P4T1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snx19Q6P4T1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snx19Q6P4T1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snx19Q6P4T1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snx19Q6P4T1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snx19Q6P4T1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Snx19Q6P4T1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snx19Q6P4T1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Snx19Q6P4T1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snx19Q6P4T1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx19Q6P4T1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx19Q6P4T1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx19Q6P4T1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx19Q6P4T1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx19Q6P4T1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx19Q6P4T1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snx19Q6P4T1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snx19Q6P4T1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snx19Q6P4T1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snx19Q6P4T1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snx19Q6P4T1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snx19Q6P4T1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snx19Q6P4T1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snx19Q6P4T1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snx19Q6P4T1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snx19Q6P4T1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snx19Q6P4T1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snx19Q6P4T1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snx19Q6P4T1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snx19Q6P4T1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snx19Q6P4T1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Snx19Q6P4T1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Snx19Q6P4T1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Snx19Q6P4T1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Snx19Q6P4T1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Snx19Q6P4T1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snx19Q6P4T1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snx19Q6P4T1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snx19Q6P4T1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snx19Q6P4T1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snx19Q6P4T1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Snx19Q6P4T1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snx19Q6P4T1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snx19Q6P4T1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Snx19Q6P4T1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snx19Q6P4T1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snx19Q6P4T1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snx19Q6P4T1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snx19Q6P4T1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snx19Q6P4T1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snx19Q6P4T1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snx19Q6P4T1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snx19Q6P4T1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snx19Q6P4T1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snx19Q6P4T1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snx19Q6P4T1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snx19Q6P4T1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snx19Q6P4T1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snx19Q6P4T1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snx19Q6P4T1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snx19Q6P4T1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snx19Q6P4T1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snx19Q6P4T1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snx19Q6P4T1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snx19Q6P4T1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snx19Q6P4T1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snx19Q6P4T1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snx19Q6P4T1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.4 ms