Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3Y9

Podnl1, Podocan-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podnl1Q6P3Y9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Podnl1Q6P3Y9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Podnl1Q6P3Y9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Podnl1Q6P3Y9 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Podnl1Q6P3Y9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Podnl1Q6P3Y9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Podnl1Q6P3Y9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Podnl1Q6P3Y9 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Podnl1Q6P3Y9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Podnl1Q6P3Y9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Podnl1Q6P3Y9 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Podnl1Q6P3Y9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Podnl1Q6P3Y9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Podnl1Q6P3Y9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Podnl1Q6P3Y9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Podnl1Q6P3Y9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Podnl1Q6P3Y9 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Podnl1Q6P3Y9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Podnl1Q6P3Y9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Podnl1Q6P3Y9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Podnl1Q6P3Y9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Podnl1Q6P3Y9 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Podnl1Q6P3Y9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Podnl1Q6P3Y9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Podnl1Q6P3Y9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Podnl1Q6P3Y9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Podnl1Q6P3Y9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Podnl1Q6P3Y9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Podnl1Q6P3Y9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Podnl1Q6P3Y9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Podnl1Q6P3Y9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Podnl1Q6P3Y9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Podnl1Q6P3Y9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Podnl1Q6P3Y9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Podnl1Q6P3Y9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Podnl1Q6P3Y9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Podnl1Q6P3Y9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Podnl1Q6P3Y9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Podnl1Q6P3Y9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Podnl1Q6P3Y9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Podnl1Q6P3Y9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Podnl1Q6P3Y9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Podnl1Q6P3Y9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Podnl1Q6P3Y9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Podnl1Q6P3Y9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Podnl1Q6P3Y9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Podnl1Q6P3Y9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Podnl1Q6P3Y9 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Podnl1Q6P3Y9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Podnl1Q6P3Y9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Podnl1Q6P3Y9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Podnl1Q6P3Y9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Podnl1Q6P3Y9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Podnl1Q6P3Y9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Podnl1Q6P3Y9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Podnl1Q6P3Y9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Podnl1Q6P3Y9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Podnl1Q6P3Y9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Podnl1Q6P3Y9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Podnl1Q6P3Y9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Podnl1Q6P3Y9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Podnl1Q6P3Y9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Podnl1Q6P3Y9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Podnl1Q6P3Y9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Podnl1Q6P3Y9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Podnl1Q6P3Y9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Podnl1Q6P3Y9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Podnl1Q6P3Y9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Podnl1Q6P3Y9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Podnl1Q6P3Y9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Podnl1Q6P3Y9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Podnl1Q6P3Y9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Podnl1Q6P3Y9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Podnl1Q6P3Y9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Podnl1Q6P3Y9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Podnl1Q6P3Y9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Podnl1Q6P3Y9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Podnl1Q6P3Y9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Podnl1Q6P3Y9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Podnl1Q6P3Y9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Podnl1Q6P3Y9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Podnl1Q6P3Y9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Podnl1Q6P3Y9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Podnl1Q6P3Y9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Podnl1Q6P3Y9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Podnl1Q6P3Y9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Podnl1Q6P3Y9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Podnl1Q6P3Y9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Podnl1Q6P3Y9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Podnl1Q6P3Y9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Podnl1Q6P3Y9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Podnl1Q6P3Y9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Podnl1Q6P3Y9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Podnl1Q6P3Y9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Podnl1Q6P3Y9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Podnl1Q6P3Y9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Podnl1Q6P3Y9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Podnl1Q6P3Y9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Podnl1Q6P3Y9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Podnl1Q6P3Y9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms