Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2L7

Casc4, Protein CASC4, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc4Q6P2L7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Casc4Q6P2L7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Casc4Q6P2L7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Casc4Q6P2L7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Casc4Q6P2L7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Casc4Q6P2L7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Casc4Q6P2L7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Casc4Q6P2L7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Casc4Q6P2L7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Casc4Q6P2L7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Casc4Q6P2L7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Casc4Q6P2L7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Casc4Q6P2L7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Casc4Q6P2L7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Casc4Q6P2L7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Casc4Q6P2L7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Casc4Q6P2L7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Casc4Q6P2L7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Casc4Q6P2L7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Casc4Q6P2L7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Casc4Q6P2L7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Casc4Q6P2L7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Casc4Q6P2L7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Casc4Q6P2L7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Casc4Q6P2L7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Casc4Q6P2L7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Casc4Q6P2L7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Casc4Q6P2L7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Casc4Q6P2L7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Casc4Q6P2L7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Casc4Q6P2L7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Casc4Q6P2L7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Casc4Q6P2L7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Casc4Q6P2L7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Casc4Q6P2L7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Casc4Q6P2L7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Casc4Q6P2L7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Casc4Q6P2L7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Casc4Q6P2L7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Casc4Q6P2L7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Casc4Q6P2L7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Casc4Q6P2L7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Casc4Q6P2L7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Casc4Q6P2L7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Casc4Q6P2L7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Casc4Q6P2L7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Casc4Q6P2L7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Casc4Q6P2L7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Casc4Q6P2L7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Casc4Q6P2L7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Casc4Q6P2L7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Casc4Q6P2L7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Casc4Q6P2L7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Casc4Q6P2L7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Casc4Q6P2L7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Casc4Q6P2L7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Casc4Q6P2L7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Casc4Q6P2L7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Casc4Q6P2L7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Casc4Q6P2L7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Casc4Q6P2L7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Casc4Q6P2L7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Casc4Q6P2L7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Casc4Q6P2L7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Casc4Q6P2L7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Casc4Q6P2L7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Casc4Q6P2L7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Casc4Q6P2L7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Casc4Q6P2L7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Casc4Q6P2L7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Casc4Q6P2L7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Casc4Q6P2L7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Casc4Q6P2L7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Casc4Q6P2L7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Casc4Q6P2L7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Casc4Q6P2L7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Casc4Q6P2L7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Casc4Q6P2L7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Casc4Q6P2L7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Casc4Q6P2L7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Casc4Q6P2L7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Casc4Q6P2L7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Casc4Q6P2L7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Casc4Q6P2L7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Casc4Q6P2L7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Casc4Q6P2L7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Casc4Q6P2L7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Casc4Q6P2L7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Casc4Q6P2L7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Casc4Q6P2L7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Casc4Q6P2L7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Casc4Q6P2L7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Casc4Q6P2L7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Casc4Q6P2L7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Casc4Q6P2L7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Casc4Q6P2L7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Casc4Q6P2L7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Casc4Q6P2L7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Casc4Q6P2L7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Casc4Q6P2L7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms