Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E7

Primpol, DNA-directed primase/polymerase protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrimpolQ6P1E7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PrimpolQ6P1E7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PrimpolQ6P1E7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PrimpolQ6P1E7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PrimpolQ6P1E7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PrimpolQ6P1E7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PrimpolQ6P1E7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PrimpolQ6P1E7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PrimpolQ6P1E7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PrimpolQ6P1E7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PrimpolQ6P1E7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PrimpolQ6P1E7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PrimpolQ6P1E7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PrimpolQ6P1E7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PrimpolQ6P1E7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PrimpolQ6P1E7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PrimpolQ6P1E7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PrimpolQ6P1E7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PrimpolQ6P1E7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PrimpolQ6P1E7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PrimpolQ6P1E7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PrimpolQ6P1E7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PrimpolQ6P1E7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PrimpolQ6P1E7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PrimpolQ6P1E7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PrimpolQ6P1E7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PrimpolQ6P1E7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PrimpolQ6P1E7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PrimpolQ6P1E7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PrimpolQ6P1E7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PrimpolQ6P1E7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PrimpolQ6P1E7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PrimpolQ6P1E7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PrimpolQ6P1E7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PrimpolQ6P1E7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PrimpolQ6P1E7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PrimpolQ6P1E7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PrimpolQ6P1E7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PrimpolQ6P1E7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PrimpolQ6P1E7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PrimpolQ6P1E7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PrimpolQ6P1E7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PrimpolQ6P1E7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PrimpolQ6P1E7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PrimpolQ6P1E7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PrimpolQ6P1E7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PrimpolQ6P1E7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PrimpolQ6P1E7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PrimpolQ6P1E7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PrimpolQ6P1E7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PrimpolQ6P1E7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PrimpolQ6P1E7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PrimpolQ6P1E7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PrimpolQ6P1E7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PrimpolQ6P1E7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PrimpolQ6P1E7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PrimpolQ6P1E7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PrimpolQ6P1E7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PrimpolQ6P1E7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PrimpolQ6P1E7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PrimpolQ6P1E7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PrimpolQ6P1E7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PrimpolQ6P1E7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PrimpolQ6P1E7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PrimpolQ6P1E7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PrimpolQ6P1E7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PrimpolQ6P1E7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PrimpolQ6P1E7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PrimpolQ6P1E7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PrimpolQ6P1E7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PrimpolQ6P1E7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PrimpolQ6P1E7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PrimpolQ6P1E7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PrimpolQ6P1E7 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PrimpolQ6P1E7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PrimpolQ6P1E7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PrimpolQ6P1E7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PrimpolQ6P1E7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PrimpolQ6P1E7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PrimpolQ6P1E7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PrimpolQ6P1E7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PrimpolQ6P1E7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PrimpolQ6P1E7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PrimpolQ6P1E7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PrimpolQ6P1E7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PrimpolQ6P1E7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PrimpolQ6P1E7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PrimpolQ6P1E7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PrimpolQ6P1E7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PrimpolQ6P1E7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PrimpolQ6P1E7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PrimpolQ6P1E7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PrimpolQ6P1E7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PrimpolQ6P1E7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PrimpolQ6P1E7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PrimpolQ6P1E7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PrimpolQ6P1E7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PrimpolQ6P1E7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PrimpolQ6P1E7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PrimpolQ6P1E7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms