Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP1

Zranb3, DNA annealing helicase and endonuclease ZRANB3, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zranb3Q6NZP1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Zranb3Q6NZP1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Zranb3Q6NZP1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Zranb3Q6NZP1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Zranb3Q6NZP1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Zranb3Q6NZP1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Zranb3Q6NZP1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Zranb3Q6NZP1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Zranb3Q6NZP1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Zranb3Q6NZP1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Zranb3Q6NZP1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Zranb3Q6NZP1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Zranb3Q6NZP1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Zranb3Q6NZP1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Zranb3Q6NZP1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Zranb3Q6NZP1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Zranb3Q6NZP1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Zranb3Q6NZP1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Zranb3Q6NZP1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Zranb3Q6NZP1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Zranb3Q6NZP1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Zranb3Q6NZP1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Zranb3Q6NZP1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Zranb3Q6NZP1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Zranb3Q6NZP1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Zranb3Q6NZP1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Zranb3Q6NZP1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Zranb3Q6NZP1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Zranb3Q6NZP1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Zranb3Q6NZP1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Zranb3Q6NZP1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Zranb3Q6NZP1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Zranb3Q6NZP1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Zranb3Q6NZP1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Zranb3Q6NZP1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Zranb3Q6NZP1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Zranb3Q6NZP1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Zranb3Q6NZP1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Zranb3Q6NZP1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Zranb3Q6NZP1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Zranb3Q6NZP1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Zranb3Q6NZP1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Zranb3Q6NZP1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Zranb3Q6NZP1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Zranb3Q6NZP1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Zranb3Q6NZP1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Zranb3Q6NZP1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Zranb3Q6NZP1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Zranb3Q6NZP1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Zranb3Q6NZP1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Zranb3Q6NZP1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Zranb3Q6NZP1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Zranb3Q6NZP1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Zranb3Q6NZP1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Zranb3Q6NZP1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Zranb3Q6NZP1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Zranb3Q6NZP1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Zranb3Q6NZP1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Zranb3Q6NZP1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Zranb3Q6NZP1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Zranb3Q6NZP1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Zranb3Q6NZP1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Zranb3Q6NZP1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Zranb3Q6NZP1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Zranb3Q6NZP1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Zranb3Q6NZP1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Zranb3Q6NZP1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Zranb3Q6NZP1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Zranb3Q6NZP1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Zranb3Q6NZP1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Zranb3Q6NZP1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Zranb3Q6NZP1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Zranb3Q6NZP1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Zranb3Q6NZP1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Zranb3Q6NZP1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Zranb3Q6NZP1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Zranb3Q6NZP1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Zranb3Q6NZP1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Zranb3Q6NZP1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Zranb3Q6NZP1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Zranb3Q6NZP1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Zranb3Q6NZP1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Zranb3Q6NZP1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Zranb3Q6NZP1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Zranb3Q6NZP1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Zranb3Q6NZP1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Zranb3Q6NZP1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Zranb3Q6NZP1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Zranb3Q6NZP1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Zranb3Q6NZP1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Zranb3Q6NZP1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Zranb3Q6NZP1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Zranb3Q6NZP1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Zranb3Q6NZP1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Zranb3Q6NZP1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Zranb3Q6NZP1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Zranb3Q6NZP1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Zranb3Q6NZP1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Zranb3Q6NZP1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Zranb3Q6NZP1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms