Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Rprd2Q6NXI6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Rprd2Q6NXI6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Rprd2Q6NXI6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Rprd2Q6NXI6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Rprd2Q6NXI6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Rprd2Q6NXI6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Rprd2Q6NXI6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Rprd2Q6NXI6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Rprd2Q6NXI6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Rprd2Q6NXI6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Rprd2Q6NXI6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Rprd2Q6NXI6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Rprd2Q6NXI6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Rprd2Q6NXI6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
Rprd2Q6NXI6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Rprd2Q6NXI6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
Rprd2Q6NXI6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Rprd2Q6NXI6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Rprd2Q6NXI6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Rprd2Q6NXI6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Rprd2Q6NXI6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Rprd2Q6NXI6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
Rprd2Q6NXI6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Rprd2Q6NXI6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Rprd2Q6NXI6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Rprd2Q6NXI6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
Rprd2Q6NXI6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Rprd2Q6NXI6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Rprd2Q6NXI6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Rprd2Q6NXI6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Rprd2Q6NXI6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Rprd2Q6NXI6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Rprd2Q6NXI6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Rprd2Q6NXI6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Rprd2Q6NXI6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Rprd2Q6NXI6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Rprd2Q6NXI6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Rprd2Q6NXI6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Rprd2Q6NXI6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Rprd2Q6NXI6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Rprd2Q6NXI6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
Rprd2Q6NXI6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
Rprd2Q6NXI6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
Rprd2Q6NXI6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Rprd2Q6NXI6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Rprd2Q6NXI6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Rprd2Q6NXI6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Rprd2Q6NXI6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Rprd2Q6NXI6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Rprd2Q6NXI6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Rprd2Q6NXI6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Rprd2Q6NXI6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Rprd2Q6NXI6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Rprd2Q6NXI6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Rprd2Q6NXI6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Rprd2Q6NXI6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Rprd2Q6NXI6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Rprd2Q6NXI6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Rprd2Q6NXI6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Rprd2Q6NXI6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
Rprd2Q6NXI6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Rprd2Q6NXI6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Rprd2Q6NXI6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
Rprd2Q6NXI6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Rprd2Q6NXI6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Rprd2Q6NXI6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Rprd2Q6NXI6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Rprd2Q6NXI6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Rprd2Q6NXI6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Rprd2Q6NXI6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Rprd2Q6NXI6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Rprd2Q6NXI6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Rprd2Q6NXI6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Rprd2Q6NXI6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Rprd2Q6NXI6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Rprd2Q6NXI6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Rprd2Q6NXI6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Rprd2Q6NXI6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Rprd2Q6NXI6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Rprd2Q6NXI6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
Rprd2Q6NXI6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Rprd2Q6NXI6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Rprd2Q6NXI6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Rprd2Q6NXI6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Rprd2Q6NXI6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
Rprd2Q6NXI6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
Rprd2Q6NXI6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Rprd2Q6NXI6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Rprd2Q6NXI6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Rprd2Q6NXI6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Rprd2Q6NXI6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Rprd2Q6NXI6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Rprd2Q6NXI6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
Rprd2Q6NXI6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Rprd2Q6NXI6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Rprd2Q6NXI6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Rprd2Q6NXI6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Rprd2Q6NXI6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Rprd2Q6NXI6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms