Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Scaf8Q6DID3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Scaf8Q6DID3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Scaf8Q6DID3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Scaf8Q6DID3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Scaf8Q6DID3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Scaf8Q6DID3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Scaf8Q6DID3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Scaf8Q6DID3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Scaf8Q6DID3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Scaf8Q6DID3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Scaf8Q6DID3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Scaf8Q6DID3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Scaf8Q6DID3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Scaf8Q6DID3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Scaf8Q6DID3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Scaf8Q6DID3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Scaf8Q6DID3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Scaf8Q6DID3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Scaf8Q6DID3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Scaf8Q6DID3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Scaf8Q6DID3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Scaf8Q6DID3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Scaf8Q6DID3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Scaf8Q6DID3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Scaf8Q6DID3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Scaf8Q6DID3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Scaf8Q6DID3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Scaf8Q6DID3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Scaf8Q6DID3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Scaf8Q6DID3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Scaf8Q6DID3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Scaf8Q6DID3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Scaf8Q6DID3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Scaf8Q6DID3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Scaf8Q6DID3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Scaf8Q6DID3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Scaf8Q6DID3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Scaf8Q6DID3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Scaf8Q6DID3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Scaf8Q6DID3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Scaf8Q6DID3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Scaf8Q6DID3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Scaf8Q6DID3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Scaf8Q6DID3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Scaf8Q6DID3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Scaf8Q6DID3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Scaf8Q6DID3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Scaf8Q6DID3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Scaf8Q6DID3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Scaf8Q6DID3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Scaf8Q6DID3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Scaf8Q6DID3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Scaf8Q6DID3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Scaf8Q6DID3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Scaf8Q6DID3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Scaf8Q6DID3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Scaf8Q6DID3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Scaf8Q6DID3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Scaf8Q6DID3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Scaf8Q6DID3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Scaf8Q6DID3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Scaf8Q6DID3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Scaf8Q6DID3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Scaf8Q6DID3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Scaf8Q6DID3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Scaf8Q6DID3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Scaf8Q6DID3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Scaf8Q6DID3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Scaf8Q6DID3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Scaf8Q6DID3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Scaf8Q6DID3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Scaf8Q6DID3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Scaf8Q6DID3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Scaf8Q6DID3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Scaf8Q6DID3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Scaf8Q6DID3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Scaf8Q6DID3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Scaf8Q6DID3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Scaf8Q6DID3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Scaf8Q6DID3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Scaf8Q6DID3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Scaf8Q6DID3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Scaf8Q6DID3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Scaf8Q6DID3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Scaf8Q6DID3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Scaf8Q6DID3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Scaf8Q6DID3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Scaf8Q6DID3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Scaf8Q6DID3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Scaf8Q6DID3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Scaf8Q6DID3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Scaf8Q6DID3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Scaf8Q6DID3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Scaf8Q6DID3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Scaf8Q6DID3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Scaf8Q6DID3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Scaf8Q6DID3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Scaf8Q6DID3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Scaf8Q6DID3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms