Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
Smarca2Q6DIC0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
Smarca2Q6DIC0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC38.9■■■■□ 3.82
Smarca2Q6DIC0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
Smarca2Q6DIC0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
Smarca2Q6DIC0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
Smarca2Q6DIC0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
Smarca2Q6DIC0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
Smarca2Q6DIC0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC38.87■■■■□ 3.81
Smarca2Q6DIC0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC38.86■■■■□ 3.81
Smarca2Q6DIC0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
Smarca2Q6DIC0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
Smarca2Q6DIC0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
Smarca2Q6DIC0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
Smarca2Q6DIC0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
Smarca2Q6DIC0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
Smarca2Q6DIC0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC38.85■■■■□ 3.81
Smarca2Q6DIC0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
Smarca2Q6DIC0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.85■■■■□ 3.81
Smarca2Q6DIC0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.85■■■■□ 3.81
Smarca2Q6DIC0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
Smarca2Q6DIC0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.84■■■■□ 3.81
Smarca2Q6DIC0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC38.84■■■■□ 3.81
Smarca2Q6DIC0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.84■■■■□ 3.81
Smarca2Q6DIC0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC38.83■■■■□ 3.81
Smarca2Q6DIC0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
Smarca2Q6DIC0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.82■■■■□ 3.81
Smarca2Q6DIC0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
Smarca2Q6DIC0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
Smarca2Q6DIC0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
Smarca2Q6DIC0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
Smarca2Q6DIC0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
Smarca2Q6DIC0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC38.81■■■■□ 3.8
Smarca2Q6DIC0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
Smarca2Q6DIC0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
Smarca2Q6DIC0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC38.8■■■■□ 3.8
Smarca2Q6DIC0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.8■■■■□ 3.8
Smarca2Q6DIC0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
Smarca2Q6DIC0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
Smarca2Q6DIC0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC38.78■■■■□ 3.8
Smarca2Q6DIC0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
Smarca2Q6DIC0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC38.78■■■■□ 3.8
Smarca2Q6DIC0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
Smarca2Q6DIC0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.78■■■■□ 3.8
Smarca2Q6DIC0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
Smarca2Q6DIC0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
Smarca2Q6DIC0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.79
Smarca2Q6DIC0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC38.75■■■■□ 3.79
Smarca2Q6DIC0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC38.75■■■■□ 3.79
Smarca2Q6DIC0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
Smarca2Q6DIC0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
Smarca2Q6DIC0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Smarca2Q6DIC0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Smarca2Q6DIC0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC38.73■■■■□ 3.79
Smarca2Q6DIC0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC38.73■■■■□ 3.79
Smarca2Q6DIC0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
Smarca2Q6DIC0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.72■■■■□ 3.79
Smarca2Q6DIC0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC38.72■■■■□ 3.79
Smarca2Q6DIC0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.72■■■■□ 3.79
Smarca2Q6DIC0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC38.72■■■■□ 3.79
Smarca2Q6DIC0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC38.72■■■■□ 3.79
Smarca2Q6DIC0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
Smarca2Q6DIC0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
Smarca2Q6DIC0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC38.71■■■■□ 3.79
Smarca2Q6DIC0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
Smarca2Q6DIC0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC38.7■■■■□ 3.79
Smarca2Q6DIC0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC38.7■■■■□ 3.79
Smarca2Q6DIC0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
Smarca2Q6DIC0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
Smarca2Q6DIC0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC38.69■■■■□ 3.78
Smarca2Q6DIC0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
Smarca2Q6DIC0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
Smarca2Q6DIC0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC38.68■■■■□ 3.78
Smarca2Q6DIC0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
Smarca2Q6DIC0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
Smarca2Q6DIC0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC38.67■■■■□ 3.78
Smarca2Q6DIC0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
Smarca2Q6DIC0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
Smarca2Q6DIC0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
Smarca2Q6DIC0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
Smarca2Q6DIC0 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC38.65■■■■□ 3.78
Smarca2Q6DIC0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC38.65■■■■□ 3.78
Smarca2Q6DIC0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.65■■■■□ 3.78
Smarca2Q6DIC0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC38.65■■■■□ 3.78
Smarca2Q6DIC0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
Smarca2Q6DIC0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
Smarca2Q6DIC0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC38.64■■■■□ 3.78
Smarca2Q6DIC0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.64■■■■□ 3.78
Smarca2Q6DIC0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
Smarca2Q6DIC0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
Smarca2Q6DIC0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Smarca2Q6DIC0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.61■■■■□ 3.77
Smarca2Q6DIC0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
Smarca2Q6DIC0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.61■■■■□ 3.77
Smarca2Q6DIC0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
Smarca2Q6DIC0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC38.61■■■■□ 3.77
Smarca2Q6DIC0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.61■■■■□ 3.77
Smarca2Q6DIC0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
Smarca2Q6DIC0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
Smarca2Q6DIC0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms