Protein–RNA interactions for Protein: Q64310

Surf4, Surfeit locus protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf4Q64310 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Surf4Q64310 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Surf4Q64310 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Surf4Q64310 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Surf4Q64310 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Surf4Q64310 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Surf4Q64310 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Surf4Q64310 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Surf4Q64310 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Surf4Q64310 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Surf4Q64310 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Surf4Q64310 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Surf4Q64310 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Surf4Q64310 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Surf4Q64310 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Surf4Q64310 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Surf4Q64310 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Surf4Q64310 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Surf4Q64310 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Surf4Q64310 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Surf4Q64310 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Surf4Q64310 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Surf4Q64310 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Surf4Q64310 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Surf4Q64310 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Surf4Q64310 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Surf4Q64310 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Surf4Q64310 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Surf4Q64310 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Surf4Q64310 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Surf4Q64310 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Surf4Q64310 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Surf4Q64310 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Surf4Q64310 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Surf4Q64310 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Surf4Q64310 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Surf4Q64310 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Surf4Q64310 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Surf4Q64310 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Surf4Q64310 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Surf4Q64310 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Surf4Q64310 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Surf4Q64310 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Surf4Q64310 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Surf4Q64310 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Surf4Q64310 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Surf4Q64310 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Surf4Q64310 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Surf4Q64310 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Surf4Q64310 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Surf4Q64310 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Surf4Q64310 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Surf4Q64310 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Surf4Q64310 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Surf4Q64310 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Surf4Q64310 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Surf4Q64310 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Surf4Q64310 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Surf4Q64310 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Surf4Q64310 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Surf4Q64310 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Surf4Q64310 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Surf4Q64310 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Surf4Q64310 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Surf4Q64310 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Surf4Q64310 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Surf4Q64310 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Surf4Q64310 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Surf4Q64310 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Surf4Q64310 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Surf4Q64310 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Surf4Q64310 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Surf4Q64310 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Surf4Q64310 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Surf4Q64310 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Surf4Q64310 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Surf4Q64310 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Surf4Q64310 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Surf4Q64310 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Surf4Q64310 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Surf4Q64310 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Surf4Q64310 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Surf4Q64310 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Surf4Q64310 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Surf4Q64310 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Surf4Q64310 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Surf4Q64310 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Surf4Q64310 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Surf4Q64310 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Surf4Q64310 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Surf4Q64310 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Surf4Q64310 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Surf4Q64310 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Surf4Q64310 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Surf4Q64310 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Surf4Q64310 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Surf4Q64310 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Surf4Q64310 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Surf4Q64310 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Surf4Q64310 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms