Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Irf4Q64287 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Irf4Q64287 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Irf4Q64287 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Irf4Q64287 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Irf4Q64287 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Irf4Q64287 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Irf4Q64287 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Irf4Q64287 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Irf4Q64287 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Irf4Q64287 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Irf4Q64287 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Irf4Q64287 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Irf4Q64287 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Irf4Q64287 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Irf4Q64287 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Irf4Q64287 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Irf4Q64287 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Irf4Q64287 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Irf4Q64287 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Irf4Q64287 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Irf4Q64287 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Irf4Q64287 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Irf4Q64287 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Irf4Q64287 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Irf4Q64287 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Irf4Q64287 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Irf4Q64287 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Irf4Q64287 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Irf4Q64287 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Irf4Q64287 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Irf4Q64287 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Irf4Q64287 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Irf4Q64287 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Irf4Q64287 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Irf4Q64287 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Irf4Q64287 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Irf4Q64287 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Irf4Q64287 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Irf4Q64287 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Irf4Q64287 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Irf4Q64287 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Irf4Q64287 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Irf4Q64287 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Irf4Q64287 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Irf4Q64287 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Irf4Q64287 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Irf4Q64287 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Irf4Q64287 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Irf4Q64287 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Irf4Q64287 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Irf4Q64287 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Irf4Q64287 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Irf4Q64287 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Irf4Q64287 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Irf4Q64287 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Irf4Q64287 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Irf4Q64287 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Irf4Q64287 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Irf4Q64287 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Irf4Q64287 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Irf4Q64287 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Irf4Q64287 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Irf4Q64287 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Irf4Q64287 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Irf4Q64287 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Irf4Q64287 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Irf4Q64287 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Irf4Q64287 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Irf4Q64287 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Irf4Q64287 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Irf4Q64287 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Irf4Q64287 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Irf4Q64287 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Irf4Q64287 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Irf4Q64287 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Irf4Q64287 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Irf4Q64287 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Irf4Q64287 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Irf4Q64287 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Irf4Q64287 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Irf4Q64287 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Irf4Q64287 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Irf4Q64287 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Irf4Q64287 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Irf4Q64287 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Irf4Q64287 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Irf4Q64287 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Irf4Q64287 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Irf4Q64287 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Irf4Q64287 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Irf4Q64287 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Irf4Q64287 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Irf4Q64287 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Irf4Q64287 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Irf4Q64287 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Irf4Q64287 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Irf4Q64287 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Irf4Q64287 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Irf4Q64287 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms