Protein–RNA interactions for Protein: Q62507

Coch, Cochlin, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CochQ62507 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CochQ62507 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CochQ62507 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CochQ62507 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CochQ62507 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CochQ62507 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CochQ62507 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CochQ62507 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CochQ62507 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CochQ62507 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CochQ62507 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CochQ62507 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CochQ62507 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CochQ62507 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CochQ62507 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CochQ62507 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CochQ62507 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CochQ62507 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CochQ62507 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CochQ62507 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CochQ62507 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CochQ62507 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CochQ62507 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CochQ62507 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CochQ62507 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CochQ62507 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CochQ62507 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CochQ62507 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CochQ62507 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CochQ62507 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CochQ62507 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CochQ62507 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CochQ62507 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CochQ62507 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CochQ62507 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CochQ62507 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CochQ62507 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CochQ62507 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CochQ62507 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CochQ62507 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CochQ62507 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CochQ62507 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CochQ62507 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CochQ62507 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CochQ62507 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CochQ62507 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CochQ62507 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CochQ62507 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CochQ62507 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CochQ62507 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CochQ62507 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CochQ62507 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CochQ62507 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CochQ62507 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CochQ62507 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CochQ62507 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CochQ62507 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CochQ62507 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CochQ62507 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CochQ62507 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CochQ62507 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CochQ62507 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CochQ62507 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CochQ62507 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CochQ62507 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CochQ62507 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CochQ62507 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CochQ62507 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CochQ62507 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CochQ62507 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CochQ62507 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CochQ62507 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CochQ62507 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CochQ62507 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CochQ62507 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CochQ62507 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CochQ62507 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CochQ62507 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CochQ62507 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CochQ62507 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CochQ62507 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CochQ62507 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CochQ62507 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CochQ62507 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CochQ62507 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CochQ62507 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CochQ62507 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CochQ62507 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CochQ62507 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CochQ62507 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CochQ62507 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CochQ62507 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CochQ62507 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CochQ62507 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CochQ62507 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CochQ62507 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CochQ62507 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CochQ62507 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CochQ62507 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CochQ62507 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms