Protein–RNA interactions for Protein: Q62468

Vil1, Villin-1, mousemouse

Predictions only

Length 827 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vil1Q62468 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Vil1Q62468 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Vil1Q62468 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Vil1Q62468 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Vil1Q62468 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Vil1Q62468 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Vil1Q62468 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Vil1Q62468 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Vil1Q62468 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Vil1Q62468 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Vil1Q62468 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Vil1Q62468 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Vil1Q62468 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Vil1Q62468 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Vil1Q62468 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Vil1Q62468 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Vil1Q62468 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Vil1Q62468 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Vil1Q62468 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Vil1Q62468 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Vil1Q62468 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Vil1Q62468 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Vil1Q62468 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Vil1Q62468 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Vil1Q62468 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Vil1Q62468 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Vil1Q62468 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Vil1Q62468 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Vil1Q62468 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Vil1Q62468 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Vil1Q62468 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Vil1Q62468 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Vil1Q62468 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Vil1Q62468 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Vil1Q62468 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Vil1Q62468 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Vil1Q62468 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Vil1Q62468 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Vil1Q62468 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Vil1Q62468 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Vil1Q62468 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Vil1Q62468 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Vil1Q62468 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Vil1Q62468 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Vil1Q62468 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Vil1Q62468 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Vil1Q62468 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Vil1Q62468 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Vil1Q62468 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Vil1Q62468 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Vil1Q62468 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Vil1Q62468 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Vil1Q62468 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Vil1Q62468 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Vil1Q62468 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Vil1Q62468 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Vil1Q62468 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Vil1Q62468 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Vil1Q62468 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Vil1Q62468 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Vil1Q62468 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Vil1Q62468 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Vil1Q62468 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Vil1Q62468 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Vil1Q62468 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Vil1Q62468 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Vil1Q62468 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Vil1Q62468 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Vil1Q62468 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Vil1Q62468 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Vil1Q62468 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Vil1Q62468 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Vil1Q62468 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Vil1Q62468 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Vil1Q62468 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Vil1Q62468 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Vil1Q62468 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Vil1Q62468 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Vil1Q62468 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Vil1Q62468 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Vil1Q62468 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Vil1Q62468 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Vil1Q62468 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Vil1Q62468 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Vil1Q62468 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Vil1Q62468 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Vil1Q62468 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Vil1Q62468 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Vil1Q62468 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Vil1Q62468 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Vil1Q62468 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Vil1Q62468 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Vil1Q62468 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Vil1Q62468 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Vil1Q62468 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Vil1Q62468 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Vil1Q62468 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Vil1Q62468 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Vil1Q62468 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vil1Q62468 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms