Protein–RNA interactions for Protein: Q62419

Sh3gl1, Endophilin-A2, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3gl1Q62419 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sh3gl1Q62419 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Sh3gl1Q62419 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sh3gl1Q62419 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sh3gl1Q62419 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sh3gl1Q62419 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sh3gl1Q62419 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sh3gl1Q62419 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sh3gl1Q62419 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sh3gl1Q62419 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sh3gl1Q62419 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sh3gl1Q62419 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sh3gl1Q62419 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sh3gl1Q62419 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sh3gl1Q62419 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Sh3gl1Q62419 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sh3gl1Q62419 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sh3gl1Q62419 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sh3gl1Q62419 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sh3gl1Q62419 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sh3gl1Q62419 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sh3gl1Q62419 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sh3gl1Q62419 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sh3gl1Q62419 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sh3gl1Q62419 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sh3gl1Q62419 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sh3gl1Q62419 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sh3gl1Q62419 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sh3gl1Q62419 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3gl1Q62419 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3gl1Q62419 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3gl1Q62419 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3gl1Q62419 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3gl1Q62419 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3gl1Q62419 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sh3gl1Q62419 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sh3gl1Q62419 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sh3gl1Q62419 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sh3gl1Q62419 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sh3gl1Q62419 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sh3gl1Q62419 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sh3gl1Q62419 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sh3gl1Q62419 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sh3gl1Q62419 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sh3gl1Q62419 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sh3gl1Q62419 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sh3gl1Q62419 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sh3gl1Q62419 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Sh3gl1Q62419 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sh3gl1Q62419 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sh3gl1Q62419 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sh3gl1Q62419 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sh3gl1Q62419 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sh3gl1Q62419 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sh3gl1Q62419 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sh3gl1Q62419 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sh3gl1Q62419 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sh3gl1Q62419 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sh3gl1Q62419 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sh3gl1Q62419 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sh3gl1Q62419 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sh3gl1Q62419 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sh3gl1Q62419 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sh3gl1Q62419 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sh3gl1Q62419 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sh3gl1Q62419 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sh3gl1Q62419 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sh3gl1Q62419 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sh3gl1Q62419 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sh3gl1Q62419 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sh3gl1Q62419 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sh3gl1Q62419 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh3gl1Q62419 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh3gl1Q62419 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh3gl1Q62419 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh3gl1Q62419 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh3gl1Q62419 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh3gl1Q62419 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sh3gl1Q62419 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Sh3gl1Q62419 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sh3gl1Q62419 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sh3gl1Q62419 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sh3gl1Q62419 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sh3gl1Q62419 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sh3gl1Q62419 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sh3gl1Q62419 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sh3gl1Q62419 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sh3gl1Q62419 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sh3gl1Q62419 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sh3gl1Q62419 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sh3gl1Q62419 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sh3gl1Q62419 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Sh3gl1Q62419 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sh3gl1Q62419 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sh3gl1Q62419 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sh3gl1Q62419 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sh3gl1Q62419 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sh3gl1Q62419 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sh3gl1Q62419 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Sh3gl1Q62419 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms