Protein–RNA interactions for Protein: Q62393

Tpd52, Tumor protein D52, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52Q62393 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Tpd52Q62393 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tpd52Q62393 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tpd52Q62393 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tpd52Q62393 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tpd52Q62393 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tpd52Q62393 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tpd52Q62393 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tpd52Q62393 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tpd52Q62393 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tpd52Q62393 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tpd52Q62393 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tpd52Q62393 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tpd52Q62393 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tpd52Q62393 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tpd52Q62393 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tpd52Q62393 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tpd52Q62393 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tpd52Q62393 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Tpd52Q62393 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Tpd52Q62393 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tpd52Q62393 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tpd52Q62393 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tpd52Q62393 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tpd52Q62393 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tpd52Q62393 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tpd52Q62393 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tpd52Q62393 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tpd52Q62393 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Tpd52Q62393 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tpd52Q62393 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tpd52Q62393 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tpd52Q62393 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tpd52Q62393 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tpd52Q62393 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tpd52Q62393 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Tpd52Q62393 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tpd52Q62393 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tpd52Q62393 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tpd52Q62393 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tpd52Q62393 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tpd52Q62393 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tpd52Q62393 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tpd52Q62393 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Tpd52Q62393 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tpd52Q62393 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tpd52Q62393 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tpd52Q62393 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tpd52Q62393 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tpd52Q62393 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tpd52Q62393 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tpd52Q62393 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tpd52Q62393 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tpd52Q62393 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tpd52Q62393 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tpd52Q62393 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tpd52Q62393 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tpd52Q62393 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Tpd52Q62393 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tpd52Q62393 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tpd52Q62393 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tpd52Q62393 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tpd52Q62393 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tpd52Q62393 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Tpd52Q62393 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tpd52Q62393 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tpd52Q62393 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tpd52Q62393 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tpd52Q62393 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Tpd52Q62393 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tpd52Q62393 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tpd52Q62393 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tpd52Q62393 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tpd52Q62393 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tpd52Q62393 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tpd52Q62393 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tpd52Q62393 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tpd52Q62393 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tpd52Q62393 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tpd52Q62393 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tpd52Q62393 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tpd52Q62393 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tpd52Q62393 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tpd52Q62393 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tpd52Q62393 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tpd52Q62393 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tpd52Q62393 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tpd52Q62393 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tpd52Q62393 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Tpd52Q62393 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Tpd52Q62393 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tpd52Q62393 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tpd52Q62393 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tpd52Q62393 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tpd52Q62393 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tpd52Q62393 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tpd52Q62393 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tpd52Q62393 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tpd52Q62393 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tpd52Q62393 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms