Protein–RNA interactions for Protein: Q62148

Aldh1a2, Retinal dehydrogenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a2Q62148 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Aldh1a2Q62148 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Aldh1a2Q62148 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Aldh1a2Q62148 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Aldh1a2Q62148 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Aldh1a2Q62148 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Aldh1a2Q62148 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Aldh1a2Q62148 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Aldh1a2Q62148 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Aldh1a2Q62148 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Aldh1a2Q62148 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Aldh1a2Q62148 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Aldh1a2Q62148 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Aldh1a2Q62148 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Aldh1a2Q62148 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Aldh1a2Q62148 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Aldh1a2Q62148 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Aldh1a2Q62148 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Aldh1a2Q62148 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Aldh1a2Q62148 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Aldh1a2Q62148 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Aldh1a2Q62148 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Aldh1a2Q62148 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Aldh1a2Q62148 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Aldh1a2Q62148 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Aldh1a2Q62148 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Aldh1a2Q62148 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Aldh1a2Q62148 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Aldh1a2Q62148 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Aldh1a2Q62148 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Aldh1a2Q62148 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Aldh1a2Q62148 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Aldh1a2Q62148 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Aldh1a2Q62148 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Aldh1a2Q62148 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Aldh1a2Q62148 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Aldh1a2Q62148 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Aldh1a2Q62148 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Aldh1a2Q62148 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Aldh1a2Q62148 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Aldh1a2Q62148 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Aldh1a2Q62148 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Aldh1a2Q62148 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Aldh1a2Q62148 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Aldh1a2Q62148 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Aldh1a2Q62148 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Aldh1a2Q62148 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Aldh1a2Q62148 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Aldh1a2Q62148 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Aldh1a2Q62148 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Aldh1a2Q62148 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Aldh1a2Q62148 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Aldh1a2Q62148 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Aldh1a2Q62148 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Aldh1a2Q62148 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Aldh1a2Q62148 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Aldh1a2Q62148 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Aldh1a2Q62148 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Aldh1a2Q62148 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Aldh1a2Q62148 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Aldh1a2Q62148 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Aldh1a2Q62148 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Aldh1a2Q62148 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Aldh1a2Q62148 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Aldh1a2Q62148 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Aldh1a2Q62148 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Aldh1a2Q62148 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Aldh1a2Q62148 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Aldh1a2Q62148 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Aldh1a2Q62148 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Aldh1a2Q62148 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Aldh1a2Q62148 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Aldh1a2Q62148 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Aldh1a2Q62148 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Aldh1a2Q62148 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Aldh1a2Q62148 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Aldh1a2Q62148 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Aldh1a2Q62148 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Aldh1a2Q62148 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Aldh1a2Q62148 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Aldh1a2Q62148 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Aldh1a2Q62148 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Aldh1a2Q62148 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Aldh1a2Q62148 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Aldh1a2Q62148 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Aldh1a2Q62148 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Aldh1a2Q62148 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Aldh1a2Q62148 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Aldh1a2Q62148 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Aldh1a2Q62148 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Aldh1a2Q62148 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Aldh1a2Q62148 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Aldh1a2Q62148 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Aldh1a2Q62148 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Aldh1a2Q62148 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Aldh1a2Q62148 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Aldh1a2Q62148 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Aldh1a2Q62148 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Aldh1a2Q62148 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Aldh1a2Q62148 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms