Protein–RNA interactions for Protein: Q62132

Ptprr, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprrQ62132 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprrQ62132 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprrQ62132 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprrQ62132 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprrQ62132 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprrQ62132 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprrQ62132 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprrQ62132 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprrQ62132 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprrQ62132 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprrQ62132 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprrQ62132 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprrQ62132 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprrQ62132 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprrQ62132 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprrQ62132 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprrQ62132 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprrQ62132 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprrQ62132 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprrQ62132 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprrQ62132 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprrQ62132 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprrQ62132 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprrQ62132 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprrQ62132 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprrQ62132 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprrQ62132 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprrQ62132 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprrQ62132 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprrQ62132 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprrQ62132 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprrQ62132 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprrQ62132 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprrQ62132 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprrQ62132 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprrQ62132 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprrQ62132 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprrQ62132 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprrQ62132 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprrQ62132 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprrQ62132 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprrQ62132 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprrQ62132 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprrQ62132 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprrQ62132 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprrQ62132 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprrQ62132 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprrQ62132 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprrQ62132 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprrQ62132 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprrQ62132 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprrQ62132 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprrQ62132 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprrQ62132 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprrQ62132 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprrQ62132 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprrQ62132 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprrQ62132 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprrQ62132 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprrQ62132 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprrQ62132 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprrQ62132 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprrQ62132 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprrQ62132 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprrQ62132 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprrQ62132 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprrQ62132 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprrQ62132 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprrQ62132 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprrQ62132 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprrQ62132 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprrQ62132 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprrQ62132 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprrQ62132 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprrQ62132 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprrQ62132 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprrQ62132 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprrQ62132 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprrQ62132 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprrQ62132 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprrQ62132 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprrQ62132 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprrQ62132 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprrQ62132 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprrQ62132 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprrQ62132 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprrQ62132 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprrQ62132 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprrQ62132 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprrQ62132 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprrQ62132 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprrQ62132 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprrQ62132 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprrQ62132 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprrQ62132 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprrQ62132 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprrQ62132 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprrQ62132 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
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PtprrQ62132 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms