Protein–RNA interactions for Protein: Q61810

Ltbp3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltbp3Q61810 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ltbp3Q61810 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ltbp3Q61810 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ltbp3Q61810 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ltbp3Q61810 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ltbp3Q61810 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ltbp3Q61810 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ltbp3Q61810 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ltbp3Q61810 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ltbp3Q61810 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ltbp3Q61810 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ltbp3Q61810 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ltbp3Q61810 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ltbp3Q61810 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ltbp3Q61810 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ltbp3Q61810 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ltbp3Q61810 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ltbp3Q61810 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ltbp3Q61810 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ltbp3Q61810 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ltbp3Q61810 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ltbp3Q61810 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ltbp3Q61810 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ltbp3Q61810 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ltbp3Q61810 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ltbp3Q61810 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ltbp3Q61810 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ltbp3Q61810 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ltbp3Q61810 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ltbp3Q61810 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ltbp3Q61810 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ltbp3Q61810 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ltbp3Q61810 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ltbp3Q61810 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ltbp3Q61810 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ltbp3Q61810 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ltbp3Q61810 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ltbp3Q61810 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ltbp3Q61810 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ltbp3Q61810 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ltbp3Q61810 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ltbp3Q61810 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ltbp3Q61810 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ltbp3Q61810 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ltbp3Q61810 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ltbp3Q61810 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ltbp3Q61810 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ltbp3Q61810 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ltbp3Q61810 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ltbp3Q61810 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ltbp3Q61810 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ltbp3Q61810 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ltbp3Q61810 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ltbp3Q61810 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ltbp3Q61810 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ltbp3Q61810 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ltbp3Q61810 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ltbp3Q61810 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ltbp3Q61810 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ltbp3Q61810 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ltbp3Q61810 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ltbp3Q61810 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ltbp3Q61810 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ltbp3Q61810 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ltbp3Q61810 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ltbp3Q61810 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ltbp3Q61810 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ltbp3Q61810 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ltbp3Q61810 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ltbp3Q61810 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ltbp3Q61810 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ltbp3Q61810 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ltbp3Q61810 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ltbp3Q61810 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ltbp3Q61810 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ltbp3Q61810 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ltbp3Q61810 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ltbp3Q61810 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ltbp3Q61810 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ltbp3Q61810 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ltbp3Q61810 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ltbp3Q61810 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ltbp3Q61810 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ltbp3Q61810 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ltbp3Q61810 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ltbp3Q61810 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ltbp3Q61810 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ltbp3Q61810 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ltbp3Q61810 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ltbp3Q61810 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ltbp3Q61810 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ltbp3Q61810 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ltbp3Q61810 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ltbp3Q61810 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ltbp3Q61810 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ltbp3Q61810 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ltbp3Q61810 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ltbp3Q61810 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ltbp3Q61810 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ltbp3Q61810 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms