Protein–RNA interactions for Protein: Q60954

Meis1, Homeobox protein Meis1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis1Q60954 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Meis1Q60954 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Meis1Q60954 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Meis1Q60954 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Meis1Q60954 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Meis1Q60954 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Meis1Q60954 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Meis1Q60954 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Meis1Q60954 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Meis1Q60954 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Meis1Q60954 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Meis1Q60954 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Meis1Q60954 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Meis1Q60954 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Meis1Q60954 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Meis1Q60954 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Meis1Q60954 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Meis1Q60954 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Meis1Q60954 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Meis1Q60954 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Meis1Q60954 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Meis1Q60954 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Meis1Q60954 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Meis1Q60954 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Meis1Q60954 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Meis1Q60954 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Meis1Q60954 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Meis1Q60954 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Meis1Q60954 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Meis1Q60954 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Meis1Q60954 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Meis1Q60954 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Meis1Q60954 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Meis1Q60954 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Meis1Q60954 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Meis1Q60954 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Meis1Q60954 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Meis1Q60954 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Meis1Q60954 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Meis1Q60954 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Meis1Q60954 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Meis1Q60954 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Meis1Q60954 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Meis1Q60954 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Meis1Q60954 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Meis1Q60954 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Meis1Q60954 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Meis1Q60954 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Meis1Q60954 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Meis1Q60954 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Meis1Q60954 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Meis1Q60954 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Meis1Q60954 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Meis1Q60954 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Meis1Q60954 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Meis1Q60954 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Meis1Q60954 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Meis1Q60954 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Meis1Q60954 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Meis1Q60954 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Meis1Q60954 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Meis1Q60954 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Meis1Q60954 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Meis1Q60954 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Meis1Q60954 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Meis1Q60954 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Meis1Q60954 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Meis1Q60954 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Meis1Q60954 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Meis1Q60954 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Meis1Q60954 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Meis1Q60954 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Meis1Q60954 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Meis1Q60954 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Meis1Q60954 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Meis1Q60954 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Meis1Q60954 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Meis1Q60954 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Meis1Q60954 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Meis1Q60954 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Meis1Q60954 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Meis1Q60954 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Meis1Q60954 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Meis1Q60954 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Meis1Q60954 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Meis1Q60954 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Meis1Q60954 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Meis1Q60954 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Meis1Q60954 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Meis1Q60954 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Meis1Q60954 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Meis1Q60954 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Meis1Q60954 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Meis1Q60954 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Meis1Q60954 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Meis1Q60954 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Meis1Q60954 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Meis1Q60954 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Meis1Q60954 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Meis1Q60954 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms