Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Grik1Q60934 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Grik1Q60934 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Grik1Q60934 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Grik1Q60934 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Grik1Q60934 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Grik1Q60934 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Grik1Q60934 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Grik1Q60934 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Grik1Q60934 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Grik1Q60934 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Grik1Q60934 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Grik1Q60934 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Grik1Q60934 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Grik1Q60934 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Grik1Q60934 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Grik1Q60934 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Grik1Q60934 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Grik1Q60934 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Grik1Q60934 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Grik1Q60934 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Grik1Q60934 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Grik1Q60934 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Grik1Q60934 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Grik1Q60934 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Grik1Q60934 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Grik1Q60934 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Grik1Q60934 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Grik1Q60934 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Grik1Q60934 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Grik1Q60934 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Grik1Q60934 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Grik1Q60934 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Grik1Q60934 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Grik1Q60934 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Grik1Q60934 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Grik1Q60934 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Grik1Q60934 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Grik1Q60934 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Grik1Q60934 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Grik1Q60934 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Grik1Q60934 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Grik1Q60934 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Grik1Q60934 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Grik1Q60934 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Grik1Q60934 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Grik1Q60934 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Grik1Q60934 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Grik1Q60934 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Grik1Q60934 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Grik1Q60934 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Grik1Q60934 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Grik1Q60934 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grik1Q60934 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grik1Q60934 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grik1Q60934 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grik1Q60934 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grik1Q60934 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grik1Q60934 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grik1Q60934 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Grik1Q60934 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Grik1Q60934 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Grik1Q60934 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Grik1Q60934 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Grik1Q60934 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Grik1Q60934 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Grik1Q60934 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Grik1Q60934 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Grik1Q60934 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Grik1Q60934 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Grik1Q60934 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Grik1Q60934 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Grik1Q60934 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Grik1Q60934 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Grik1Q60934 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Grik1Q60934 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Grik1Q60934 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Grik1Q60934 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Grik1Q60934 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Grik1Q60934 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Grik1Q60934 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Grik1Q60934 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Grik1Q60934 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Grik1Q60934 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Grik1Q60934 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Grik1Q60934 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Grik1Q60934 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Grik1Q60934 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Grik1Q60934 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Grik1Q60934 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Grik1Q60934 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Grik1Q60934 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Grik1Q60934 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Grik1Q60934 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Grik1Q60934 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Grik1Q60934 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Grik1Q60934 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Grik1Q60934 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Grik1Q60934 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Grik1Q60934 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms