Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Neurod1Q60867 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Neurod1Q60867 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Neurod1Q60867 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Neurod1Q60867 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Neurod1Q60867 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Neurod1Q60867 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Neurod1Q60867 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Neurod1Q60867 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Neurod1Q60867 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Neurod1Q60867 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Neurod1Q60867 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Neurod1Q60867 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Neurod1Q60867 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Neurod1Q60867 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Neurod1Q60867 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Neurod1Q60867 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
Neurod1Q60867 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Neurod1Q60867 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Neurod1Q60867 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Neurod1Q60867 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Neurod1Q60867 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Neurod1Q60867 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Neurod1Q60867 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Neurod1Q60867 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Neurod1Q60867 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Neurod1Q60867 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Neurod1Q60867 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Neurod1Q60867 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Neurod1Q60867 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Neurod1Q60867 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Neurod1Q60867 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Neurod1Q60867 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Neurod1Q60867 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Neurod1Q60867 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
Neurod1Q60867 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Neurod1Q60867 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Neurod1Q60867 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Neurod1Q60867 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Neurod1Q60867 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Neurod1Q60867 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Neurod1Q60867 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Neurod1Q60867 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Neurod1Q60867 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Neurod1Q60867 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Neurod1Q60867 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Neurod1Q60867 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Neurod1Q60867 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Neurod1Q60867 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Neurod1Q60867 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Neurod1Q60867 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Neurod1Q60867 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Neurod1Q60867 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
Neurod1Q60867 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Neurod1Q60867 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Neurod1Q60867 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Neurod1Q60867 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Neurod1Q60867 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Neurod1Q60867 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Neurod1Q60867 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
Neurod1Q60867 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Neurod1Q60867 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
Neurod1Q60867 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
Neurod1Q60867 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Neurod1Q60867 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Neurod1Q60867 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Neurod1Q60867 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Neurod1Q60867 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Neurod1Q60867 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Neurod1Q60867 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Neurod1Q60867 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Neurod1Q60867 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Neurod1Q60867 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Neurod1Q60867 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Neurod1Q60867 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Neurod1Q60867 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Neurod1Q60867 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Neurod1Q60867 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Neurod1Q60867 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
Neurod1Q60867 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Neurod1Q60867 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Neurod1Q60867 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Neurod1Q60867 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Neurod1Q60867 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Neurod1Q60867 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Neurod1Q60867 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Neurod1Q60867 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Neurod1Q60867 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Neurod1Q60867 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Neurod1Q60867 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
Neurod1Q60867 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.6
Neurod1Q60867 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Neurod1Q60867 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Neurod1Q60867 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Neurod1Q60867 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Neurod1Q60867 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Neurod1Q60867 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Neurod1Q60867 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Neurod1Q60867 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Neurod1Q60867 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms