Protein–RNA interactions for Protein: Q60778

Nfkbib, NF-kappa-B inhibitor beta, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbibQ60778 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NfkbibQ60778 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NfkbibQ60778 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NfkbibQ60778 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NfkbibQ60778 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NfkbibQ60778 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NfkbibQ60778 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NfkbibQ60778 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NfkbibQ60778 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NfkbibQ60778 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NfkbibQ60778 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NfkbibQ60778 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NfkbibQ60778 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NfkbibQ60778 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
NfkbibQ60778 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NfkbibQ60778 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NfkbibQ60778 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NfkbibQ60778 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NfkbibQ60778 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NfkbibQ60778 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NfkbibQ60778 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NfkbibQ60778 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NfkbibQ60778 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NfkbibQ60778 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NfkbibQ60778 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NfkbibQ60778 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NfkbibQ60778 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NfkbibQ60778 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NfkbibQ60778 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NfkbibQ60778 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NfkbibQ60778 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NfkbibQ60778 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NfkbibQ60778 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NfkbibQ60778 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NfkbibQ60778 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NfkbibQ60778 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NfkbibQ60778 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NfkbibQ60778 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NfkbibQ60778 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NfkbibQ60778 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NfkbibQ60778 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NfkbibQ60778 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NfkbibQ60778 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NfkbibQ60778 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NfkbibQ60778 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NfkbibQ60778 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NfkbibQ60778 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NfkbibQ60778 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NfkbibQ60778 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NfkbibQ60778 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NfkbibQ60778 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NfkbibQ60778 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NfkbibQ60778 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NfkbibQ60778 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NfkbibQ60778 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NfkbibQ60778 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NfkbibQ60778 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NfkbibQ60778 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NfkbibQ60778 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NfkbibQ60778 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NfkbibQ60778 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NfkbibQ60778 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NfkbibQ60778 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NfkbibQ60778 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NfkbibQ60778 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NfkbibQ60778 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NfkbibQ60778 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NfkbibQ60778 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NfkbibQ60778 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NfkbibQ60778 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NfkbibQ60778 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NfkbibQ60778 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NfkbibQ60778 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NfkbibQ60778 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NfkbibQ60778 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NfkbibQ60778 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NfkbibQ60778 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NfkbibQ60778 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NfkbibQ60778 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NfkbibQ60778 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NfkbibQ60778 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NfkbibQ60778 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NfkbibQ60778 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NfkbibQ60778 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NfkbibQ60778 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NfkbibQ60778 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NfkbibQ60778 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NfkbibQ60778 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NfkbibQ60778 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NfkbibQ60778 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NfkbibQ60778 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NfkbibQ60778 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NfkbibQ60778 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
NfkbibQ60778 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NfkbibQ60778 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NfkbibQ60778 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NfkbibQ60778 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NfkbibQ60778 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NfkbibQ60778 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NfkbibQ60778 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms