Protein–RNA interactions for Protein: Q60722

Tcf4, Transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf4Q60722 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tcf4Q60722 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tcf4Q60722 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tcf4Q60722 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tcf4Q60722 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tcf4Q60722 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tcf4Q60722 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tcf4Q60722 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tcf4Q60722 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tcf4Q60722 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tcf4Q60722 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tcf4Q60722 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tcf4Q60722 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tcf4Q60722 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tcf4Q60722 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tcf4Q60722 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tcf4Q60722 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tcf4Q60722 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tcf4Q60722 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tcf4Q60722 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tcf4Q60722 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tcf4Q60722 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tcf4Q60722 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tcf4Q60722 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tcf4Q60722 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tcf4Q60722 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tcf4Q60722 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tcf4Q60722 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Tcf4Q60722 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tcf4Q60722 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tcf4Q60722 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tcf4Q60722 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tcf4Q60722 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tcf4Q60722 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tcf4Q60722 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tcf4Q60722 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tcf4Q60722 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tcf4Q60722 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tcf4Q60722 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tcf4Q60722 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tcf4Q60722 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tcf4Q60722 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tcf4Q60722 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tcf4Q60722 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tcf4Q60722 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tcf4Q60722 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tcf4Q60722 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tcf4Q60722 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tcf4Q60722 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tcf4Q60722 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tcf4Q60722 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tcf4Q60722 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tcf4Q60722 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tcf4Q60722 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tcf4Q60722 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tcf4Q60722 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Tcf4Q60722 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tcf4Q60722 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Tcf4Q60722 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tcf4Q60722 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tcf4Q60722 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tcf4Q60722 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tcf4Q60722 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tcf4Q60722 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tcf4Q60722 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tcf4Q60722 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tcf4Q60722 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tcf4Q60722 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tcf4Q60722 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tcf4Q60722 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcf4Q60722 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcf4Q60722 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcf4Q60722 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcf4Q60722 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcf4Q60722 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcf4Q60722 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcf4Q60722 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tcf4Q60722 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Tcf4Q60722 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tcf4Q60722 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Tcf4Q60722 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tcf4Q60722 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tcf4Q60722 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tcf4Q60722 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tcf4Q60722 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tcf4Q60722 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tcf4Q60722 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tcf4Q60722 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tcf4Q60722 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tcf4Q60722 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tcf4Q60722 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tcf4Q60722 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tcf4Q60722 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tcf4Q60722 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tcf4Q60722 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tcf4Q60722 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tcf4Q60722 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tcf4Q60722 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tcf4Q60722 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tcf4Q60722 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.9 ms