Protein–RNA interactions for Protein: Q60698

Ski, Ski oncogene, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkiQ60698 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SkiQ60698 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SkiQ60698 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SkiQ60698 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SkiQ60698 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SkiQ60698 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SkiQ60698 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SkiQ60698 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SkiQ60698 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SkiQ60698 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SkiQ60698 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SkiQ60698 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SkiQ60698 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SkiQ60698 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SkiQ60698 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SkiQ60698 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SkiQ60698 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SkiQ60698 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SkiQ60698 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SkiQ60698 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SkiQ60698 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SkiQ60698 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SkiQ60698 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SkiQ60698 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SkiQ60698 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SkiQ60698 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SkiQ60698 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SkiQ60698 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SkiQ60698 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SkiQ60698 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SkiQ60698 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SkiQ60698 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SkiQ60698 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SkiQ60698 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SkiQ60698 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SkiQ60698 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SkiQ60698 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SkiQ60698 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SkiQ60698 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SkiQ60698 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SkiQ60698 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SkiQ60698 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SkiQ60698 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SkiQ60698 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SkiQ60698 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SkiQ60698 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SkiQ60698 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SkiQ60698 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SkiQ60698 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SkiQ60698 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SkiQ60698 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SkiQ60698 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SkiQ60698 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SkiQ60698 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SkiQ60698 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SkiQ60698 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SkiQ60698 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SkiQ60698 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SkiQ60698 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SkiQ60698 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SkiQ60698 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SkiQ60698 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SkiQ60698 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SkiQ60698 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SkiQ60698 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SkiQ60698 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SkiQ60698 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SkiQ60698 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SkiQ60698 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SkiQ60698 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SkiQ60698 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SkiQ60698 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SkiQ60698 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SkiQ60698 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SkiQ60698 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SkiQ60698 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SkiQ60698 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SkiQ60698 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SkiQ60698 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SkiQ60698 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SkiQ60698 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SkiQ60698 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SkiQ60698 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SkiQ60698 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SkiQ60698 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SkiQ60698 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SkiQ60698 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SkiQ60698 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SkiQ60698 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SkiQ60698 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SkiQ60698 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SkiQ60698 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SkiQ60698 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SkiQ60698 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SkiQ60698 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SkiQ60698 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SkiQ60698 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SkiQ60698 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SkiQ60698 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SkiQ60698 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms