Protein–RNA interactions for Protein: Q60632

Nr2f1, COUP transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f1Q60632 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nr2f1Q60632 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nr2f1Q60632 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nr2f1Q60632 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nr2f1Q60632 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nr2f1Q60632 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nr2f1Q60632 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nr2f1Q60632 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nr2f1Q60632 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nr2f1Q60632 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nr2f1Q60632 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nr2f1Q60632 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Nr2f1Q60632 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nr2f1Q60632 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nr2f1Q60632 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nr2f1Q60632 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nr2f1Q60632 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nr2f1Q60632 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nr2f1Q60632 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nr2f1Q60632 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nr2f1Q60632 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nr2f1Q60632 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nr2f1Q60632 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nr2f1Q60632 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Nr2f1Q60632 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nr2f1Q60632 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nr2f1Q60632 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nr2f1Q60632 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nr2f1Q60632 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nr2f1Q60632 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nr2f1Q60632 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nr2f1Q60632 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nr2f1Q60632 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nr2f1Q60632 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nr2f1Q60632 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nr2f1Q60632 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nr2f1Q60632 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nr2f1Q60632 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nr2f1Q60632 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nr2f1Q60632 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nr2f1Q60632 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nr2f1Q60632 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nr2f1Q60632 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nr2f1Q60632 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nr2f1Q60632 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nr2f1Q60632 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nr2f1Q60632 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nr2f1Q60632 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nr2f1Q60632 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nr2f1Q60632 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nr2f1Q60632 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nr2f1Q60632 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nr2f1Q60632 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nr2f1Q60632 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nr2f1Q60632 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nr2f1Q60632 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nr2f1Q60632 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nr2f1Q60632 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nr2f1Q60632 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nr2f1Q60632 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nr2f1Q60632 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nr2f1Q60632 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nr2f1Q60632 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nr2f1Q60632 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nr2f1Q60632 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nr2f1Q60632 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nr2f1Q60632 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nr2f1Q60632 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nr2f1Q60632 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nr2f1Q60632 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nr2f1Q60632 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nr2f1Q60632 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nr2f1Q60632 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nr2f1Q60632 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nr2f1Q60632 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nr2f1Q60632 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nr2f1Q60632 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Nr2f1Q60632 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nr2f1Q60632 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Nr2f1Q60632 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Nr2f1Q60632 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nr2f1Q60632 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nr2f1Q60632 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nr2f1Q60632 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nr2f1Q60632 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nr2f1Q60632 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nr2f1Q60632 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nr2f1Q60632 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Nr2f1Q60632 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nr2f1Q60632 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nr2f1Q60632 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nr2f1Q60632 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nr2f1Q60632 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nr2f1Q60632 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nr2f1Q60632 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nr2f1Q60632 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nr2f1Q60632 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nr2f1Q60632 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nr2f1Q60632 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nr2f1Q60632 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms