Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4C3

Scaf1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf1Q5U4C3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Scaf1Q5U4C3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Scaf1Q5U4C3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Scaf1Q5U4C3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Scaf1Q5U4C3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Scaf1Q5U4C3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Scaf1Q5U4C3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Scaf1Q5U4C3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Scaf1Q5U4C3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Scaf1Q5U4C3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Scaf1Q5U4C3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Scaf1Q5U4C3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Scaf1Q5U4C3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Scaf1Q5U4C3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Scaf1Q5U4C3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Scaf1Q5U4C3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Scaf1Q5U4C3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Scaf1Q5U4C3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Scaf1Q5U4C3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Scaf1Q5U4C3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Scaf1Q5U4C3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
Scaf1Q5U4C3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Scaf1Q5U4C3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Scaf1Q5U4C3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Scaf1Q5U4C3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Scaf1Q5U4C3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Scaf1Q5U4C3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Scaf1Q5U4C3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Scaf1Q5U4C3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Scaf1Q5U4C3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Scaf1Q5U4C3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Scaf1Q5U4C3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Scaf1Q5U4C3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Scaf1Q5U4C3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Scaf1Q5U4C3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Scaf1Q5U4C3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Scaf1Q5U4C3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Scaf1Q5U4C3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Scaf1Q5U4C3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Scaf1Q5U4C3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Scaf1Q5U4C3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Scaf1Q5U4C3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Scaf1Q5U4C3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Scaf1Q5U4C3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Scaf1Q5U4C3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Scaf1Q5U4C3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Scaf1Q5U4C3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Scaf1Q5U4C3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Scaf1Q5U4C3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Scaf1Q5U4C3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Scaf1Q5U4C3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Scaf1Q5U4C3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Scaf1Q5U4C3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Scaf1Q5U4C3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Scaf1Q5U4C3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Scaf1Q5U4C3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Scaf1Q5U4C3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Scaf1Q5U4C3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Scaf1Q5U4C3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Scaf1Q5U4C3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Scaf1Q5U4C3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Scaf1Q5U4C3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Scaf1Q5U4C3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Scaf1Q5U4C3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
Scaf1Q5U4C3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Scaf1Q5U4C3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Scaf1Q5U4C3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Scaf1Q5U4C3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Scaf1Q5U4C3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Scaf1Q5U4C3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Scaf1Q5U4C3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Scaf1Q5U4C3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Scaf1Q5U4C3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Scaf1Q5U4C3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Scaf1Q5U4C3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Scaf1Q5U4C3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Scaf1Q5U4C3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Scaf1Q5U4C3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Scaf1Q5U4C3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Scaf1Q5U4C3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Scaf1Q5U4C3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Scaf1Q5U4C3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Scaf1Q5U4C3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Scaf1Q5U4C3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Scaf1Q5U4C3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Scaf1Q5U4C3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Scaf1Q5U4C3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Scaf1Q5U4C3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Scaf1Q5U4C3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Scaf1Q5U4C3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Scaf1Q5U4C3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Scaf1Q5U4C3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Scaf1Q5U4C3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Scaf1Q5U4C3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Scaf1Q5U4C3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Scaf1Q5U4C3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Scaf1Q5U4C3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Scaf1Q5U4C3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Scaf1Q5U4C3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Scaf1Q5U4C3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms