Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4C1

Gprasp1, G-protein coupled receptor-associated sorting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gprasp1Q5U4C1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Gprasp1Q5U4C1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Gprasp1Q5U4C1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Gprasp1Q5U4C1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Gprasp1Q5U4C1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Gprasp1Q5U4C1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Gprasp1Q5U4C1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Gprasp1Q5U4C1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Gprasp1Q5U4C1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Gprasp1Q5U4C1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Gprasp1Q5U4C1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Gprasp1Q5U4C1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Gprasp1Q5U4C1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Gprasp1Q5U4C1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Gprasp1Q5U4C1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Gprasp1Q5U4C1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Gprasp1Q5U4C1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Gprasp1Q5U4C1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Gprasp1Q5U4C1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Gprasp1Q5U4C1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
Gprasp1Q5U4C1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
Gprasp1Q5U4C1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Gprasp1Q5U4C1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Gprasp1Q5U4C1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Gprasp1Q5U4C1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Gprasp1Q5U4C1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Gprasp1Q5U4C1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Gprasp1Q5U4C1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Gprasp1Q5U4C1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Gprasp1Q5U4C1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Gprasp1Q5U4C1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Gprasp1Q5U4C1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Gprasp1Q5U4C1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Gprasp1Q5U4C1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Gprasp1Q5U4C1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Gprasp1Q5U4C1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Gprasp1Q5U4C1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Gprasp1Q5U4C1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Gprasp1Q5U4C1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Gprasp1Q5U4C1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Gprasp1Q5U4C1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Gprasp1Q5U4C1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Gprasp1Q5U4C1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Gprasp1Q5U4C1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Gprasp1Q5U4C1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Gprasp1Q5U4C1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Gprasp1Q5U4C1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Gprasp1Q5U4C1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Gprasp1Q5U4C1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Gprasp1Q5U4C1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Gprasp1Q5U4C1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Gprasp1Q5U4C1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Gprasp1Q5U4C1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Gprasp1Q5U4C1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Gprasp1Q5U4C1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Gprasp1Q5U4C1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Gprasp1Q5U4C1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Gprasp1Q5U4C1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Gprasp1Q5U4C1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Gprasp1Q5U4C1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Gprasp1Q5U4C1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Gprasp1Q5U4C1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Gprasp1Q5U4C1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Gprasp1Q5U4C1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Gprasp1Q5U4C1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Gprasp1Q5U4C1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Gprasp1Q5U4C1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Gprasp1Q5U4C1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Gprasp1Q5U4C1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Gprasp1Q5U4C1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Gprasp1Q5U4C1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Gprasp1Q5U4C1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Gprasp1Q5U4C1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Gprasp1Q5U4C1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Gprasp1Q5U4C1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Gprasp1Q5U4C1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Gprasp1Q5U4C1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Gprasp1Q5U4C1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Gprasp1Q5U4C1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Gprasp1Q5U4C1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Gprasp1Q5U4C1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Gprasp1Q5U4C1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Gprasp1Q5U4C1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Gprasp1Q5U4C1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Gprasp1Q5U4C1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Gprasp1Q5U4C1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Gprasp1Q5U4C1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Gprasp1Q5U4C1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Gprasp1Q5U4C1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Gprasp1Q5U4C1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gprasp1Q5U4C1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gprasp1Q5U4C1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gprasp1Q5U4C1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gprasp1Q5U4C1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gprasp1Q5U4C1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gprasp1Q5U4C1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gprasp1Q5U4C1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gprasp1Q5U4C1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Gprasp1Q5U4C1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Gprasp1Q5U4C1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms