Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUR0

Pfas, Phosphoribosylformylglycinamidine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PfasQ5SUR0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PfasQ5SUR0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PfasQ5SUR0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PfasQ5SUR0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PfasQ5SUR0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PfasQ5SUR0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PfasQ5SUR0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PfasQ5SUR0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PfasQ5SUR0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PfasQ5SUR0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PfasQ5SUR0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PfasQ5SUR0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PfasQ5SUR0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PfasQ5SUR0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PfasQ5SUR0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PfasQ5SUR0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PfasQ5SUR0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PfasQ5SUR0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PfasQ5SUR0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PfasQ5SUR0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PfasQ5SUR0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PfasQ5SUR0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PfasQ5SUR0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PfasQ5SUR0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PfasQ5SUR0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PfasQ5SUR0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PfasQ5SUR0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PfasQ5SUR0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PfasQ5SUR0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PfasQ5SUR0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PfasQ5SUR0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PfasQ5SUR0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PfasQ5SUR0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PfasQ5SUR0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PfasQ5SUR0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PfasQ5SUR0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PfasQ5SUR0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PfasQ5SUR0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PfasQ5SUR0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PfasQ5SUR0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PfasQ5SUR0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PfasQ5SUR0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PfasQ5SUR0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PfasQ5SUR0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PfasQ5SUR0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PfasQ5SUR0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PfasQ5SUR0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PfasQ5SUR0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PfasQ5SUR0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PfasQ5SUR0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PfasQ5SUR0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PfasQ5SUR0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PfasQ5SUR0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PfasQ5SUR0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PfasQ5SUR0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PfasQ5SUR0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PfasQ5SUR0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PfasQ5SUR0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PfasQ5SUR0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PfasQ5SUR0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PfasQ5SUR0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PfasQ5SUR0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PfasQ5SUR0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PfasQ5SUR0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PfasQ5SUR0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PfasQ5SUR0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PfasQ5SUR0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PfasQ5SUR0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PfasQ5SUR0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PfasQ5SUR0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PfasQ5SUR0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PfasQ5SUR0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PfasQ5SUR0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PfasQ5SUR0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PfasQ5SUR0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PfasQ5SUR0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PfasQ5SUR0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PfasQ5SUR0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PfasQ5SUR0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PfasQ5SUR0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
PfasQ5SUR0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PfasQ5SUR0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PfasQ5SUR0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PfasQ5SUR0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PfasQ5SUR0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PfasQ5SUR0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PfasQ5SUR0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PfasQ5SUR0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PfasQ5SUR0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PfasQ5SUR0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PfasQ5SUR0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PfasQ5SUR0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PfasQ5SUR0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PfasQ5SUR0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PfasQ5SUR0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PfasQ5SUR0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PfasQ5SUR0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PfasQ5SUR0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PfasQ5SUR0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PfasQ5SUR0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms