Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUQ9

Ctc1, CST complex subunit CTC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctc1Q5SUQ9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctc1Q5SUQ9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctc1Q5SUQ9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctc1Q5SUQ9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctc1Q5SUQ9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctc1Q5SUQ9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctc1Q5SUQ9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ctc1Q5SUQ9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ctc1Q5SUQ9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ctc1Q5SUQ9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ctc1Q5SUQ9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ctc1Q5SUQ9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctc1Q5SUQ9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctc1Q5SUQ9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctc1Q5SUQ9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctc1Q5SUQ9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctc1Q5SUQ9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ctc1Q5SUQ9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ctc1Q5SUQ9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ctc1Q5SUQ9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ctc1Q5SUQ9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ctc1Q5SUQ9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ctc1Q5SUQ9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ctc1Q5SUQ9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ctc1Q5SUQ9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ctc1Q5SUQ9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ctc1Q5SUQ9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ctc1Q5SUQ9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ctc1Q5SUQ9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ctc1Q5SUQ9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ctc1Q5SUQ9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ctc1Q5SUQ9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ctc1Q5SUQ9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ctc1Q5SUQ9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ctc1Q5SUQ9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ctc1Q5SUQ9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ctc1Q5SUQ9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ctc1Q5SUQ9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ctc1Q5SUQ9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ctc1Q5SUQ9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ctc1Q5SUQ9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctc1Q5SUQ9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctc1Q5SUQ9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctc1Q5SUQ9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctc1Q5SUQ9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctc1Q5SUQ9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctc1Q5SUQ9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctc1Q5SUQ9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ctc1Q5SUQ9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ctc1Q5SUQ9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ctc1Q5SUQ9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ctc1Q5SUQ9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ctc1Q5SUQ9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ctc1Q5SUQ9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ctc1Q5SUQ9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctc1Q5SUQ9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctc1Q5SUQ9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctc1Q5SUQ9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctc1Q5SUQ9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctc1Q5SUQ9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctc1Q5SUQ9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctc1Q5SUQ9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctc1Q5SUQ9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctc1Q5SUQ9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctc1Q5SUQ9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctc1Q5SUQ9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctc1Q5SUQ9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctc1Q5SUQ9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctc1Q5SUQ9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctc1Q5SUQ9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctc1Q5SUQ9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ctc1Q5SUQ9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ctc1Q5SUQ9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ctc1Q5SUQ9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ctc1Q5SUQ9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ctc1Q5SUQ9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ctc1Q5SUQ9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ctc1Q5SUQ9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ctc1Q5SUQ9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctc1Q5SUQ9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctc1Q5SUQ9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctc1Q5SUQ9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctc1Q5SUQ9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctc1Q5SUQ9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctc1Q5SUQ9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctc1Q5SUQ9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctc1Q5SUQ9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctc1Q5SUQ9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctc1Q5SUQ9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctc1Q5SUQ9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctc1Q5SUQ9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctc1Q5SUQ9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctc1Q5SUQ9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctc1Q5SUQ9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctc1Q5SUQ9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctc1Q5SUQ9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctc1Q5SUQ9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctc1Q5SUQ9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctc1Q5SUQ9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctc1Q5SUQ9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms