Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSA0

Vmn1r223, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r223Q5SSA0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vmn1r223Q5SSA0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vmn1r223Q5SSA0 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vmn1r223Q5SSA0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vmn1r223Q5SSA0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vmn1r223Q5SSA0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vmn1r223Q5SSA0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vmn1r223Q5SSA0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vmn1r223Q5SSA0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vmn1r223Q5SSA0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vmn1r223Q5SSA0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vmn1r223Q5SSA0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vmn1r223Q5SSA0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vmn1r223Q5SSA0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vmn1r223Q5SSA0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vmn1r223Q5SSA0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vmn1r223Q5SSA0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vmn1r223Q5SSA0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vmn1r223Q5SSA0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Vmn1r223Q5SSA0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vmn1r223Q5SSA0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vmn1r223Q5SSA0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vmn1r223Q5SSA0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vmn1r223Q5SSA0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vmn1r223Q5SSA0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vmn1r223Q5SSA0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Vmn1r223Q5SSA0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vmn1r223Q5SSA0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vmn1r223Q5SSA0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vmn1r223Q5SSA0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r223Q5SSA0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r223Q5SSA0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r223Q5SSA0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r223Q5SSA0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r223Q5SSA0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r223Q5SSA0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r223Q5SSA0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r223Q5SSA0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r223Q5SSA0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r223Q5SSA0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r223Q5SSA0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r223Q5SSA0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r223Q5SSA0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r223Q5SSA0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r223Q5SSA0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r223Q5SSA0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r223Q5SSA0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r223Q5SSA0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r223Q5SSA0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r223Q5SSA0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r223Q5SSA0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r223Q5SSA0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r223Q5SSA0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r223Q5SSA0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r223Q5SSA0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r223Q5SSA0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r223Q5SSA0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r223Q5SSA0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r223Q5SSA0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r223Q5SSA0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r223Q5SSA0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r223Q5SSA0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r223Q5SSA0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r223Q5SSA0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r223Q5SSA0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r223Q5SSA0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r223Q5SSA0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r223Q5SSA0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r223Q5SSA0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r223Q5SSA0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r223Q5SSA0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vmn1r223Q5SSA0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vmn1r223Q5SSA0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r223Q5SSA0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r223Q5SSA0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r223Q5SSA0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r223Q5SSA0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r223Q5SSA0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r223Q5SSA0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r223Q5SSA0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r223Q5SSA0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r223Q5SSA0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r223Q5SSA0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r223Q5SSA0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r223Q5SSA0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r223Q5SSA0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r223Q5SSA0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r223Q5SSA0 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r223Q5SSA0 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r223Q5SSA0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r223Q5SSA0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r223Q5SSA0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r223Q5SSA0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r223Q5SSA0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r223Q5SSA0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r223Q5SSA0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r223Q5SSA0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r223Q5SSA0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r223Q5SSA0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r223Q5SSA0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms