Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQX6

Cyfip2, Cytoplasmic FMR1-interacting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyfip2Q5SQX6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cyfip2Q5SQX6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cyfip2Q5SQX6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cyfip2Q5SQX6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cyfip2Q5SQX6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cyfip2Q5SQX6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cyfip2Q5SQX6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cyfip2Q5SQX6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cyfip2Q5SQX6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cyfip2Q5SQX6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cyfip2Q5SQX6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cyfip2Q5SQX6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cyfip2Q5SQX6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cyfip2Q5SQX6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cyfip2Q5SQX6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cyfip2Q5SQX6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cyfip2Q5SQX6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cyfip2Q5SQX6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cyfip2Q5SQX6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
Cyfip2Q5SQX6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cyfip2Q5SQX6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cyfip2Q5SQX6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cyfip2Q5SQX6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cyfip2Q5SQX6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cyfip2Q5SQX6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cyfip2Q5SQX6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cyfip2Q5SQX6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cyfip2Q5SQX6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cyfip2Q5SQX6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cyfip2Q5SQX6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cyfip2Q5SQX6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cyfip2Q5SQX6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cyfip2Q5SQX6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cyfip2Q5SQX6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cyfip2Q5SQX6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cyfip2Q5SQX6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cyfip2Q5SQX6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cyfip2Q5SQX6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cyfip2Q5SQX6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cyfip2Q5SQX6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cyfip2Q5SQX6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cyfip2Q5SQX6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cyfip2Q5SQX6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cyfip2Q5SQX6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cyfip2Q5SQX6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cyfip2Q5SQX6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cyfip2Q5SQX6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Cyfip2Q5SQX6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cyfip2Q5SQX6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cyfip2Q5SQX6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cyfip2Q5SQX6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cyfip2Q5SQX6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cyfip2Q5SQX6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cyfip2Q5SQX6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cyfip2Q5SQX6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cyfip2Q5SQX6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cyfip2Q5SQX6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cyfip2Q5SQX6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cyfip2Q5SQX6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cyfip2Q5SQX6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cyfip2Q5SQX6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cyfip2Q5SQX6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cyfip2Q5SQX6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Cyfip2Q5SQX6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cyfip2Q5SQX6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cyfip2Q5SQX6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cyfip2Q5SQX6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cyfip2Q5SQX6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cyfip2Q5SQX6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cyfip2Q5SQX6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cyfip2Q5SQX6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cyfip2Q5SQX6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cyfip2Q5SQX6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cyfip2Q5SQX6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cyfip2Q5SQX6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cyfip2Q5SQX6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cyfip2Q5SQX6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cyfip2Q5SQX6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cyfip2Q5SQX6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cyfip2Q5SQX6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cyfip2Q5SQX6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cyfip2Q5SQX6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cyfip2Q5SQX6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cyfip2Q5SQX6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cyfip2Q5SQX6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cyfip2Q5SQX6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cyfip2Q5SQX6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cyfip2Q5SQX6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cyfip2Q5SQX6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cyfip2Q5SQX6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cyfip2Q5SQX6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cyfip2Q5SQX6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cyfip2Q5SQX6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cyfip2Q5SQX6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cyfip2Q5SQX6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cyfip2Q5SQX6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cyfip2Q5SQX6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cyfip2Q5SQX6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cyfip2Q5SQX6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cyfip2Q5SQX6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms