Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPX3

Rnf215, RING finger protein 215, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf215Q5SPX3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnf215Q5SPX3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnf215Q5SPX3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnf215Q5SPX3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnf215Q5SPX3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnf215Q5SPX3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnf215Q5SPX3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnf215Q5SPX3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf215Q5SPX3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf215Q5SPX3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf215Q5SPX3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf215Q5SPX3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf215Q5SPX3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf215Q5SPX3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf215Q5SPX3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf215Q5SPX3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf215Q5SPX3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf215Q5SPX3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf215Q5SPX3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf215Q5SPX3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf215Q5SPX3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf215Q5SPX3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf215Q5SPX3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf215Q5SPX3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf215Q5SPX3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf215Q5SPX3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf215Q5SPX3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf215Q5SPX3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf215Q5SPX3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf215Q5SPX3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf215Q5SPX3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf215Q5SPX3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf215Q5SPX3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf215Q5SPX3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf215Q5SPX3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf215Q5SPX3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf215Q5SPX3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf215Q5SPX3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf215Q5SPX3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf215Q5SPX3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf215Q5SPX3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnf215Q5SPX3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnf215Q5SPX3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnf215Q5SPX3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnf215Q5SPX3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnf215Q5SPX3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnf215Q5SPX3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnf215Q5SPX3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf215Q5SPX3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf215Q5SPX3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf215Q5SPX3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf215Q5SPX3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf215Q5SPX3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf215Q5SPX3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf215Q5SPX3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf215Q5SPX3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf215Q5SPX3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnf215Q5SPX3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnf215Q5SPX3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnf215Q5SPX3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnf215Q5SPX3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnf215Q5SPX3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnf215Q5SPX3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnf215Q5SPX3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnf215Q5SPX3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf215Q5SPX3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf215Q5SPX3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf215Q5SPX3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf215Q5SPX3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf215Q5SPX3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf215Q5SPX3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf215Q5SPX3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf215Q5SPX3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf215Q5SPX3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnf215Q5SPX3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnf215Q5SPX3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnf215Q5SPX3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnf215Q5SPX3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnf215Q5SPX3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnf215Q5SPX3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnf215Q5SPX3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Rnf215Q5SPX3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnf215Q5SPX3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnf215Q5SPX3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnf215Q5SPX3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnf215Q5SPX3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnf215Q5SPX3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnf215Q5SPX3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnf215Q5SPX3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnf215Q5SPX3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnf215Q5SPX3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnf215Q5SPX3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnf215Q5SPX3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rnf215Q5SPX3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rnf215Q5SPX3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rnf215Q5SPX3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rnf215Q5SPX3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rnf215Q5SPX3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rnf215Q5SPX3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rnf215Q5SPX3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms