Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJI4

Pkdcc, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PkdccQ5RJI4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PkdccQ5RJI4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PkdccQ5RJI4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PkdccQ5RJI4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PkdccQ5RJI4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PkdccQ5RJI4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PkdccQ5RJI4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PkdccQ5RJI4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PkdccQ5RJI4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PkdccQ5RJI4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PkdccQ5RJI4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PkdccQ5RJI4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PkdccQ5RJI4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PkdccQ5RJI4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PkdccQ5RJI4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PkdccQ5RJI4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PkdccQ5RJI4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PkdccQ5RJI4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PkdccQ5RJI4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PkdccQ5RJI4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PkdccQ5RJI4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PkdccQ5RJI4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PkdccQ5RJI4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PkdccQ5RJI4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PkdccQ5RJI4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PkdccQ5RJI4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PkdccQ5RJI4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PkdccQ5RJI4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PkdccQ5RJI4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PkdccQ5RJI4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PkdccQ5RJI4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PkdccQ5RJI4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PkdccQ5RJI4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PkdccQ5RJI4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PkdccQ5RJI4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PkdccQ5RJI4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PkdccQ5RJI4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PkdccQ5RJI4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PkdccQ5RJI4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PkdccQ5RJI4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PkdccQ5RJI4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PkdccQ5RJI4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PkdccQ5RJI4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PkdccQ5RJI4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PkdccQ5RJI4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PkdccQ5RJI4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PkdccQ5RJI4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PkdccQ5RJI4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PkdccQ5RJI4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PkdccQ5RJI4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PkdccQ5RJI4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PkdccQ5RJI4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PkdccQ5RJI4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PkdccQ5RJI4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PkdccQ5RJI4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PkdccQ5RJI4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PkdccQ5RJI4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PkdccQ5RJI4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PkdccQ5RJI4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PkdccQ5RJI4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PkdccQ5RJI4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PkdccQ5RJI4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PkdccQ5RJI4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PkdccQ5RJI4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PkdccQ5RJI4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PkdccQ5RJI4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PkdccQ5RJI4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PkdccQ5RJI4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PkdccQ5RJI4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PkdccQ5RJI4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PkdccQ5RJI4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PkdccQ5RJI4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PkdccQ5RJI4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PkdccQ5RJI4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PkdccQ5RJI4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PkdccQ5RJI4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PkdccQ5RJI4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PkdccQ5RJI4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PkdccQ5RJI4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PkdccQ5RJI4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PkdccQ5RJI4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PkdccQ5RJI4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PkdccQ5RJI4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PkdccQ5RJI4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PkdccQ5RJI4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PkdccQ5RJI4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PkdccQ5RJI4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PkdccQ5RJI4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PkdccQ5RJI4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PkdccQ5RJI4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PkdccQ5RJI4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PkdccQ5RJI4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PkdccQ5RJI4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PkdccQ5RJI4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PkdccQ5RJI4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PkdccQ5RJI4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PkdccQ5RJI4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PkdccQ5RJI4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PkdccQ5RJI4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PkdccQ5RJI4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms