Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Ecm2Q5FW85 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Ecm2Q5FW85 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Ecm2Q5FW85 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Ecm2Q5FW85 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Ecm2Q5FW85 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Ecm2Q5FW85 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Ecm2Q5FW85 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
Ecm2Q5FW85 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Ecm2Q5FW85 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Ecm2Q5FW85 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Ecm2Q5FW85 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Ecm2Q5FW85 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Ecm2Q5FW85 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ecm2Q5FW85 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ecm2Q5FW85 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ecm2Q5FW85 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Ecm2Q5FW85 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
Ecm2Q5FW85 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Ecm2Q5FW85 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Ecm2Q5FW85 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Ecm2Q5FW85 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
Ecm2Q5FW85 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.45
Ecm2Q5FW85 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
Ecm2Q5FW85 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Ecm2Q5FW85 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Ecm2Q5FW85 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Ecm2Q5FW85 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Ecm2Q5FW85 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Ecm2Q5FW85 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Ecm2Q5FW85 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Ecm2Q5FW85 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Ecm2Q5FW85 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Ecm2Q5FW85 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Ecm2Q5FW85 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Ecm2Q5FW85 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Ecm2Q5FW85 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Ecm2Q5FW85 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Ecm2Q5FW85 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Ecm2Q5FW85 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Ecm2Q5FW85 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Ecm2Q5FW85 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Ecm2Q5FW85 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Ecm2Q5FW85 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Ecm2Q5FW85 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Ecm2Q5FW85 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Ecm2Q5FW85 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ecm2Q5FW85 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
Ecm2Q5FW85 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ecm2Q5FW85 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ecm2Q5FW85 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ecm2Q5FW85 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ecm2Q5FW85 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ecm2Q5FW85 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ecm2Q5FW85 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ecm2Q5FW85 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
Ecm2Q5FW85 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ecm2Q5FW85 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ecm2Q5FW85 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ecm2Q5FW85 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ecm2Q5FW85 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ecm2Q5FW85 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
Ecm2Q5FW85 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ecm2Q5FW85 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ecm2Q5FW85 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
Ecm2Q5FW85 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ecm2Q5FW85 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
Ecm2Q5FW85 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ecm2Q5FW85 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ecm2Q5FW85 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ecm2Q5FW85 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ecm2Q5FW85 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ecm2Q5FW85 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ecm2Q5FW85 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ecm2Q5FW85 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ecm2Q5FW85 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Ecm2Q5FW85 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Ecm2Q5FW85 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Ecm2Q5FW85 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ecm2Q5FW85 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
Ecm2Q5FW85 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ecm2Q5FW85 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ecm2Q5FW85 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ecm2Q5FW85 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ecm2Q5FW85 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
Ecm2Q5FW85 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ecm2Q5FW85 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ecm2Q5FW85 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ecm2Q5FW85 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ecm2Q5FW85 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ecm2Q5FW85 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ecm2Q5FW85 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Ecm2Q5FW85 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ecm2Q5FW85 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ecm2Q5FW85 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ecm2Q5FW85 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ecm2Q5FW85 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ecm2Q5FW85 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ecm2Q5FW85 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ecm2Q5FW85 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
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