Protein–RNA interactions for Protein: Q5F4S9

Trpm3, Transient receptor potential cation channel, subfamily M, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm3Q5F4S9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trpm3Q5F4S9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trpm3Q5F4S9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trpm3Q5F4S9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trpm3Q5F4S9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trpm3Q5F4S9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trpm3Q5F4S9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trpm3Q5F4S9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trpm3Q5F4S9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trpm3Q5F4S9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trpm3Q5F4S9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trpm3Q5F4S9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trpm3Q5F4S9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Trpm3Q5F4S9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Trpm3Q5F4S9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Trpm3Q5F4S9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Trpm3Q5F4S9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Trpm3Q5F4S9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Trpm3Q5F4S9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Trpm3Q5F4S9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Trpm3Q5F4S9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Trpm3Q5F4S9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Trpm3Q5F4S9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Trpm3Q5F4S9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Trpm3Q5F4S9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trpm3Q5F4S9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trpm3Q5F4S9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Trpm3Q5F4S9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trpm3Q5F4S9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Trpm3Q5F4S9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Trpm3Q5F4S9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Trpm3Q5F4S9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Trpm3Q5F4S9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Trpm3Q5F4S9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Trpm3Q5F4S9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Trpm3Q5F4S9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Trpm3Q5F4S9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Trpm3Q5F4S9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Trpm3Q5F4S9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Trpm3Q5F4S9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trpm3Q5F4S9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Trpm3Q5F4S9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trpm3Q5F4S9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trpm3Q5F4S9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Trpm3Q5F4S9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trpm3Q5F4S9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trpm3Q5F4S9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trpm3Q5F4S9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trpm3Q5F4S9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Trpm3Q5F4S9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Trpm3Q5F4S9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Trpm3Q5F4S9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Trpm3Q5F4S9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trpm3Q5F4S9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trpm3Q5F4S9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trpm3Q5F4S9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trpm3Q5F4S9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trpm3Q5F4S9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trpm3Q5F4S9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trpm3Q5F4S9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trpm3Q5F4S9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Trpm3Q5F4S9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Trpm3Q5F4S9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trpm3Q5F4S9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trpm3Q5F4S9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trpm3Q5F4S9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trpm3Q5F4S9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Trpm3Q5F4S9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Trpm3Q5F4S9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Trpm3Q5F4S9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Trpm3Q5F4S9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Trpm3Q5F4S9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Trpm3Q5F4S9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Trpm3Q5F4S9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Trpm3Q5F4S9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Trpm3Q5F4S9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Trpm3Q5F4S9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Trpm3Q5F4S9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Trpm3Q5F4S9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Trpm3Q5F4S9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Trpm3Q5F4S9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Trpm3Q5F4S9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Trpm3Q5F4S9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Trpm3Q5F4S9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Trpm3Q5F4S9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Trpm3Q5F4S9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Trpm3Q5F4S9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Trpm3Q5F4S9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Trpm3Q5F4S9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Trpm3Q5F4S9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Trpm3Q5F4S9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Trpm3Q5F4S9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Trpm3Q5F4S9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Trpm3Q5F4S9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Trpm3Q5F4S9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Trpm3Q5F4S9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Trpm3Q5F4S9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Trpm3Q5F4S9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Trpm3Q5F4S9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trpm3Q5F4S9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms