Protein–RNA interactions for Protein: Q56A08

Gpkow, G-patch domain and KOW motifs-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpkowQ56A08 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
GpkowQ56A08 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GpkowQ56A08 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GpkowQ56A08 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GpkowQ56A08 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GpkowQ56A08 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GpkowQ56A08 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GpkowQ56A08 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GpkowQ56A08 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GpkowQ56A08 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GpkowQ56A08 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GpkowQ56A08 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GpkowQ56A08 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GpkowQ56A08 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GpkowQ56A08 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GpkowQ56A08 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GpkowQ56A08 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GpkowQ56A08 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GpkowQ56A08 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GpkowQ56A08 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GpkowQ56A08 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GpkowQ56A08 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GpkowQ56A08 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
GpkowQ56A08 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GpkowQ56A08 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GpkowQ56A08 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GpkowQ56A08 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GpkowQ56A08 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GpkowQ56A08 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GpkowQ56A08 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GpkowQ56A08 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GpkowQ56A08 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GpkowQ56A08 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GpkowQ56A08 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GpkowQ56A08 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GpkowQ56A08 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GpkowQ56A08 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GpkowQ56A08 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GpkowQ56A08 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GpkowQ56A08 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GpkowQ56A08 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GpkowQ56A08 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GpkowQ56A08 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GpkowQ56A08 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
GpkowQ56A08 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GpkowQ56A08 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
GpkowQ56A08 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GpkowQ56A08 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GpkowQ56A08 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GpkowQ56A08 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GpkowQ56A08 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GpkowQ56A08 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GpkowQ56A08 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
GpkowQ56A08 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
GpkowQ56A08 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
GpkowQ56A08 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GpkowQ56A08 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GpkowQ56A08 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
GpkowQ56A08 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GpkowQ56A08 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GpkowQ56A08 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GpkowQ56A08 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GpkowQ56A08 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GpkowQ56A08 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GpkowQ56A08 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GpkowQ56A08 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
GpkowQ56A08 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
GpkowQ56A08 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GpkowQ56A08 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GpkowQ56A08 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GpkowQ56A08 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GpkowQ56A08 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GpkowQ56A08 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GpkowQ56A08 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GpkowQ56A08 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GpkowQ56A08 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GpkowQ56A08 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GpkowQ56A08 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GpkowQ56A08 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GpkowQ56A08 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GpkowQ56A08 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GpkowQ56A08 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GpkowQ56A08 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GpkowQ56A08 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GpkowQ56A08 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GpkowQ56A08 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GpkowQ56A08 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GpkowQ56A08 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GpkowQ56A08 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GpkowQ56A08 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GpkowQ56A08 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GpkowQ56A08 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GpkowQ56A08 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GpkowQ56A08 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GpkowQ56A08 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GpkowQ56A08 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GpkowQ56A08 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GpkowQ56A08 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GpkowQ56A08 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GpkowQ56A08 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms