Protein–RNA interactions for Protein: Q497S0

Gm5935, EG546282 protein, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5935Q497S0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm5935Q497S0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm5935Q497S0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm5935Q497S0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm5935Q497S0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm5935Q497S0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm5935Q497S0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm5935Q497S0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm5935Q497S0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm5935Q497S0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm5935Q497S0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm5935Q497S0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm5935Q497S0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm5935Q497S0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm5935Q497S0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm5935Q497S0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm5935Q497S0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm5935Q497S0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm5935Q497S0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm5935Q497S0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm5935Q497S0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm5935Q497S0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm5935Q497S0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm5935Q497S0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm5935Q497S0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm5935Q497S0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm5935Q497S0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm5935Q497S0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm5935Q497S0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm5935Q497S0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm5935Q497S0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm5935Q497S0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm5935Q497S0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm5935Q497S0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm5935Q497S0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm5935Q497S0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm5935Q497S0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm5935Q497S0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm5935Q497S0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm5935Q497S0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm5935Q497S0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm5935Q497S0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm5935Q497S0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm5935Q497S0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm5935Q497S0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm5935Q497S0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm5935Q497S0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm5935Q497S0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm5935Q497S0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm5935Q497S0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm5935Q497S0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm5935Q497S0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm5935Q497S0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gm5935Q497S0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm5935Q497S0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm5935Q497S0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm5935Q497S0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm5935Q497S0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm5935Q497S0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm5935Q497S0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm5935Q497S0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm5935Q497S0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm5935Q497S0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm5935Q497S0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm5935Q497S0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm5935Q497S0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm5935Q497S0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm5935Q497S0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm5935Q497S0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm5935Q497S0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm5935Q497S0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm5935Q497S0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm5935Q497S0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm5935Q497S0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm5935Q497S0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm5935Q497S0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm5935Q497S0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm5935Q497S0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm5935Q497S0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm5935Q497S0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm5935Q497S0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm5935Q497S0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm5935Q497S0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm5935Q497S0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm5935Q497S0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm5935Q497S0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm5935Q497S0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm5935Q497S0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm5935Q497S0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm5935Q497S0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm5935Q497S0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Gm5935Q497S0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm5935Q497S0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm5935Q497S0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm5935Q497S0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm5935Q497S0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm5935Q497S0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm5935Q497S0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm5935Q497S0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm5935Q497S0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 162 ms