Protein–RNA interactions for Protein: Q3V384

Afg1l, AFG1-like ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg1lQ3V384 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Afg1lQ3V384 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Afg1lQ3V384 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Afg1lQ3V384 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Afg1lQ3V384 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Afg1lQ3V384 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Afg1lQ3V384 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Afg1lQ3V384 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Afg1lQ3V384 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Afg1lQ3V384 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Afg1lQ3V384 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Afg1lQ3V384 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Afg1lQ3V384 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Afg1lQ3V384 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Afg1lQ3V384 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Afg1lQ3V384 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Afg1lQ3V384 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Afg1lQ3V384 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Afg1lQ3V384 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Afg1lQ3V384 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Afg1lQ3V384 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Afg1lQ3V384 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Afg1lQ3V384 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Afg1lQ3V384 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Afg1lQ3V384 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Afg1lQ3V384 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Afg1lQ3V384 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Afg1lQ3V384 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Afg1lQ3V384 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Afg1lQ3V384 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Afg1lQ3V384 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Afg1lQ3V384 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Afg1lQ3V384 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Afg1lQ3V384 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Afg1lQ3V384 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Afg1lQ3V384 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Afg1lQ3V384 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Afg1lQ3V384 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Afg1lQ3V384 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Afg1lQ3V384 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Afg1lQ3V384 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Afg1lQ3V384 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Afg1lQ3V384 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Afg1lQ3V384 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Afg1lQ3V384 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Afg1lQ3V384 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Afg1lQ3V384 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Afg1lQ3V384 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Afg1lQ3V384 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Afg1lQ3V384 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Afg1lQ3V384 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Afg1lQ3V384 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Afg1lQ3V384 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Afg1lQ3V384 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Afg1lQ3V384 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Afg1lQ3V384 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Afg1lQ3V384 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Afg1lQ3V384 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Afg1lQ3V384 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Afg1lQ3V384 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Afg1lQ3V384 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Afg1lQ3V384 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Afg1lQ3V384 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Afg1lQ3V384 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Afg1lQ3V384 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Afg1lQ3V384 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Afg1lQ3V384 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Afg1lQ3V384 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Afg1lQ3V384 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Afg1lQ3V384 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Afg1lQ3V384 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Afg1lQ3V384 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Afg1lQ3V384 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Afg1lQ3V384 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Afg1lQ3V384 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Afg1lQ3V384 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Afg1lQ3V384 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Afg1lQ3V384 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Afg1lQ3V384 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Afg1lQ3V384 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Afg1lQ3V384 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Afg1lQ3V384 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Afg1lQ3V384 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Afg1lQ3V384 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Afg1lQ3V384 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Afg1lQ3V384 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Afg1lQ3V384 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Afg1lQ3V384 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Afg1lQ3V384 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Afg1lQ3V384 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Afg1lQ3V384 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Afg1lQ3V384 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Afg1lQ3V384 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Afg1lQ3V384 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Afg1lQ3V384 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Afg1lQ3V384 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Afg1lQ3V384 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Afg1lQ3V384 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Afg1lQ3V384 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Afg1lQ3V384 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms